小粒咖啡叶绿素合成基因CaPOR的全基因组鉴定及表达分析

S571.2; 叶绿素是植物进行光合作用、积累有机物的重要物质,其中POR(pro tochlorophyllide oxidoreductase)负责催化光合体中的光合色素前体原叶绿素酸转化为叶绿素a,是光诱导被子植物转绿的关键酶,对光合作用至关重要.为研究小粒咖啡叶片叶绿素合成POR基因,通过基因家族分析和转录组测序分析,筛选和鉴定小粒咖啡POR基因,并进一步利用实时荧光定量分析关键基因的表达.结果表明,CaPOR基因家族成员蛋白质的理化性质相似,所含保守基序大致相同,在启动子区域主要以光响应元件和生长发育类元件为主.结合染色体定位、共线性分析以及密码子偏好分析发现,CaPOR基因在小粒咖...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in中国农业科技导报 Vol. 26; no. 10; pp. 83 - 97
Main Authors 张振伟, 董相书, 杨婧, 李学俊, 杞美军, 蒋快乐, 杨永林, 王步天, 施学东, 邱俊超, 陈治华, 葛宇
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 云南农业大学热带作物学院,云南 普洱 665099%云南大学资源植物研究院,昆明 650504 2024
Subjects
Coffea arabica
expression analysis
表达分析
chlorophyll
小粒咖啡
叶绿素
生物信息学分析
bioinformatic analysis
Online AccessGet full text
ISSN1008-0864
DOI10.13304/j.nykjdb.2024.0365

Cover

More Information
Summary:S571.2; 叶绿素是植物进行光合作用、积累有机物的重要物质,其中POR(pro tochlorophyllide oxidoreductase)负责催化光合体中的光合色素前体原叶绿素酸转化为叶绿素a,是光诱导被子植物转绿的关键酶,对光合作用至关重要.为研究小粒咖啡叶片叶绿素合成POR基因,通过基因家族分析和转录组测序分析,筛选和鉴定小粒咖啡POR基因,并进一步利用实时荧光定量分析关键基因的表达.结果表明,CaPOR基因家族成员蛋白质的理化性质相似,所含保守基序大致相同,在启动子区域主要以光响应元件和生长发育类元件为主.结合染色体定位、共线性分析以及密码子偏好分析发现,CaPOR基因在小粒咖啡中已形成基因簇,且出现复制加快的现象,这一现象是由碱基突变以及自然选择共同影响所致.对筛选出的7个CaPOR基因的表达量进行分析发现,在小粒咖啡叶片的生长发育过程中,7个CaPOR基因的表达量均为成熟叶片显著高于嫩叶,与小粒咖啡叶片生长发育过程中叶绿素合成变化正相关.以上研究结果为进一步揭示小粒咖啡叶片叶绿素合成以及POR基因的功能研究提供参考.
ISSN:1008-0864
DOI:10.13304/j.nykjdb.2024.0365