中国地方鸡种MHC B-LBⅡ新等位基因的遗传多态性研究

• Published in: 遗传学报 Vol. 34; no. 2; pp. 109 - 118
• Main Authors: 徐日福, 李奎, 陈国宏, 徐慧, 强巴央宗, 李长春, 刘榜
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 华中农业大学动物科技学院,武汉,430070 2007; 扬州大学动物科技系,扬州,225009%华中农业大学动物科技学院,武汉,430070%扬州大学动物科技系,扬州,225009%吉林农业大学动物科技学院,长春,130118%西藏大学农牧学院畜牧兽医系,林芝,860000
• Subjects: 遗传多态性; PCR-SSCP检测; B-LBⅡ gene; 等位基因; 中国地方鸡种; allele; indigenous Chinese chicken; PCR-SSCP assay; B-LBⅡ基因; genetic polymorphism
• ISSN: 1673-8527

S8; 为研究鸡MHCB-LBⅡ基因的遗传多态性,首先在8个中国地方鸡种(藏鸡、仙居鸡、北京油鸡、固始鸡、斗鸡、丝羽乌骨鸡、白耳鸡和狼山鸡)B-LBⅡ基因第二外显子扩增了一长度为175 bp的DNA片段并进行SSCP基因型分析;在8个地方鸡种共467个个体中检测到37个PCR-SSCP基因型;从被检样品中筛选出不同基因型的个体,并在其B-LBⅡ基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374bp的片段,通过克隆和测序获得了该片段的核苷酸序列.经序列分析,在前述地方鸡种被筛选出的30个无血缘关系的个体中发现了31个B-LBⅡ新等位基因,并参照哺乳动物MHCⅡ类B等位基因命名规则进行了命名.对这31个B-LBⅡ新等位基因长度为374bp的DNA片段进行比对表明,在其第二外显子序列上共有68个多态性变异位点,其中简约性信息位点51个,单变异位点17个,具有丰富的遗传多态性.在这些多态性变异位点中,出现在遗传密码子第一和第二位上的碱基替换率分别为36.76%和35.29%.等位基因序列间的相似性估测为90.6%-99.5%;B-LBⅡ基因第二外显子的错义替换率和同义替换率分别为14.64±2.67%和2.92±0.94%.结果表明,B-LBⅡ基因的丰富遗传多态性主要是由基因重组和平衡选择效应所引起的.对B-LBⅡ等位基因第二外显子所编码的B-LBⅡ分子β1结构域氨基酸序列比对发现,31个B-LBⅡ新等位基因属于26个等位基因主型;在β1结构域氨基酸序列的33个变异位点上,存在6个同义替换和27个错义替换.分析认为,那些发生在多肽结合位点上的氨基酸错义替换与鸡MHCB-LBⅡ分子的免疫特异性有关.该结果可为鸡的抗病育种研究提供分子生物学依据.