不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析

• Published in: 西南农业学报 Vol. 36; no. 3; pp. 522 - 531
• Main Authors: 卢源达, 陈玲, 杜云龙, 刘学思, 柯学, 赵建屛, 吴洪钦, 刘鑫, 李玉琢, 朱文强, 邢世军, 程在全, 钟巧芳
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 云南农业大学植物保护学院, 昆明 650224 2023; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室, 昆明 650205%云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室, 昆明 650205%云南农业大学植物保护学院, 昆明 650224
• Subjects: 生物信息学; ZmWRKY79; 玉米; 同源基因
• ISSN: 1001-4829
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2023.3.010

S513; [目的]玉米ZmWRKY79 基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用.文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79 同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因.[方法]从NCBI数据库中获取玉米ZmWRKY79 同源基因的基本信息,并对其进行染色体定位、基因结构可视化、功能结构域预测、进化关系分析、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件预测及非生物胁迫表达预测.[结果]在玉米、谷子、高粱、青稞、野生二粒小麦、普通小麦、水稻作物中共鉴定到9 个ZmWRKY79 同源基因,这些基因结构相似性较高,分布于不同的染色体上,且均属于第Ⅲ类WRKY转录因子.系统进化分析结果显示ZmWRKY79 蛋白同源序列可被分为I和Ⅱ类,不同成员间进化受纯化选择,其中ZmWRKY79 蛋白与高粱Sb-WRKY54 蛋白同源性较高,达到81.58％.亚细胞定位预测显示所有ZmWRKY79 同源蛋白均在细胞核,说明ZmWRKY79 同源基因均在细胞核中发挥功能.启动子顺式作用元件预测显示ZmWRKY79 同源基因的启动中主要包含组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件.非生物胁迫表达预测表明,ZmWRKY53 和ZmWRKY742 个ZmWRKY79 的同源基因被确定为受逆境胁迫诱导.[结论]在7 种禾本科作物中鉴定到9 个ZmWRKY79 同源基因,这些同源基因可能具有抗逆功能,为禾本科作物抗逆研究提供了更多的基因选择.