谷子eIF5A基因家族鉴定与分析

• Published in: 西南农业学报 Vol. 31; no. 7; pp. 1333 - 1337
• Main Authors: 张杰伟, 秦新月, 陈亚娟, 刘婧, 崔进荣, 姚磊, 魏建华
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 北京农学院植物科学技术学院,北京102206%北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京100097 2018; 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京100097%北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京100097; 内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022
• Subjects: 基因家族; 进化分析; 谷子; eIF5A
• ISSN: 1001-4829
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.7.002

S515; [目的]本文系统分析了谷子eIF5A基因家族在谷子中如何发挥作用.[方法]利用谷子基因组数据库,运用生物信息学方法,鉴定谷子eIF5A基因家族的基因结构、染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析.[结果]谷子含有4个eIF5A基因,均含有4个内显子,分布于谷子的3条染色体上.MEME保守基序分析显示,谷子eIF5A蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287).磷酸化位点预测分析表明谷子eIF5A蛋白均含有大量潜在磷酸化位点.[结论]以上结果将为今后揭示谷子eIF5A蛋白功能提供重要的线索.