核糖体S6蛋白激酶4基因在多种肿瘤中的表达及其生物信息学分析

• Published in: 实用医学杂志 Vol. 40; no. 13; pp. 1778 - 1784
• Main Authors: 杨江林, 许远红, 廖德仲
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 贵州医科大学医学检验学院(贵阳 550004) 2024; 贵州医科大学附属医院临床检验中心(贵阳 550004)%贵州中医药大学基础医学院(贵阳 550025)%贵州医科大学附属医院病理科(贵阳 550004)
• Subjects: 生物信息学; alternative splicing; 转录本; transcripts; ribosomal protein S6 kinase 4; bioinformatics; 可变剪接; 基因表达谱; 核糖体S6蛋白激酶4; gene expression spectrum
• ISSN: 1006-5725
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2024.13.003

R730.2; 目的 探讨在不同肿瘤细胞中核糖体S6蛋白激酶4(ribosomal protein S6 kinase 4,RSK4)的表达谱是否存在差异,以及预测可能存在的蛋白亚型及其生物学特性.方法 提取神经胶质瘤细胞GL261、卵巢癌细胞ID8、乳腺癌细胞4T1和168FARN、结肠癌细胞mc38和CT26、胃癌细胞MFC和肺癌细胞LLC1的RNA,采用RT-PCR技术检测RSK4的表达及其剪接异构体,生物信息学分析RSK4的生物学特征及其功能.结果 RT-PCR结果显示在GL261、4T1、mc38、CT26、MFC和LLC1中均表达RSK4,且不同的肿瘤细胞中表达了多个剪接异构体,开放阅读框分析RSK4可能至少编码11个蛋白亚型;二级结构分析显示,这些剪接异构体编码的蛋白亚型均由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲组成,且保守结构域均相同;蛋白互作网络富集分析显示,RSK4主要通过mTOR信号通路和突触持续增强等信号通路在核质和胞浆中发挥激酶的活性.结论 RSK4在不同的肿瘤细胞中存在不同的表达谱,可能产生多种氮端不同的蛋白异构体,能够通过多种信号通路参与不同的生物学途径.