基因1型HCV/HIV共同感染患者直接抗病毒药物预存耐药突变流行情况分析
R373.2; 目的·探究基因1型丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)/人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)共同感染患者直接抗病毒药物(direct-acting antiviral agents,DAAs)预存耐药突变流行情况,以期对这一特殊群体的耐药情况有所了解.方法·通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)核酸数据库进行数据挖掘,找出全部基因1型HCV/HIV共同感染患者的NS3和NS5B序列.然后用MEGA 5.0软件进行序列的比对和耐药分析.结果·总体来讲,无论基因1a型还是基因1b型,HCV/HIV共同感染患者N...
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Published in | 上海交通大学学报(医学版) Vol. 38; no. 4; pp. 411 - 415 |
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Main Authors | , , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
教育部感染性疾病分子生物学重点实验室,重庆医科大学病毒性肝炎研究所,重庆400016%四川省成都市郫县中医医院检验科,成都,611730
2018
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Subjects | |
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ISSN | 1674-8115 |
DOI | 10.3969/j.issn.1674-8115.2018.04.010 |
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Summary: | R373.2; 目的·探究基因1型丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)/人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)共同感染患者直接抗病毒药物(direct-acting antiviral agents,DAAs)预存耐药突变流行情况,以期对这一特殊群体的耐药情况有所了解.方法·通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)核酸数据库进行数据挖掘,找出全部基因1型HCV/HIV共同感染患者的NS3和NS5B序列.然后用MEGA 5.0软件进行序列的比对和耐药分析.结果·总体来讲,无论基因1a型还是基因1b型,HCV/HIV共同感染患者NS3区的预存耐药突变流行率高(分别是26.06%和38.18%).在基因1a型患者中,高耐药相关突变主要出现在Q80上(8.45%);而在基因1b型患者中,S122耐药突变最为常见(36.36%).在NS5B区的预存耐药突变罕见(0.77%),尤其是在基因1a型患者中,没有1条序列检测到耐药相关突变.结论·基因1型HCV/HIV共同感染患者NS3区的预存耐药突变流行率高,但NS5B区的预存耐药突变罕见.对HCV/HIV共同感染这一特殊群体使用DAAs治疗时,以NS5B抑制剂为基础的联合方案是很有必要的. |
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ISSN: | 1674-8115 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1674-8115.2018.04.010 |