杀虫剂处理的梨小食心虫转录组测序分析及差异表达解毒酶基因筛选
S482.3%S433.4; 试验采用药膜法测定阿维菌素、高效氯氟氰菊酯、吡虫啉对梨小食心虫的室内毒性,旨在挖掘与杀虫剂解毒代谢相关基因,为进一步研究梨小食心虫解毒代谢机制奠定基础.根据生物测定结果,分别将3种杀虫剂原药用丙酮稀释至LC10、LC30、LC50 浓度,并将健康成虫放入带有杀虫剂薄膜的玻璃瓶 24 h,收集存活的成虫,-80℃保存备用.采用Illumina HiSeq 2000进行高通量测序,获得的非重复序列基因(Unigene),使用NCBI比对工具BLAST分别与NR、NT、SWISS-PROT、Pfam、GO、KOG、KEGG数据库进行比对,获得相应的注释信息;进一步采用生...
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Published in | 山西农业科学 Vol. 51; no. 11; pp. 1233 - 1244 |
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Main Authors | , , , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
山西农业大学 植物保护学院,山西 太谷 030801%山西农业大学 果树研究所,山西 太谷 030815%澳大利亚联邦科学与工业研究组织农业与食品部,西澳 文布利 6913
2023
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Subjects | |
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ISSN | 1002-2481 |
DOI | 10.3969/j.issn.1002-2481.2023.11.01 |
Cover
Summary: | S482.3%S433.4; 试验采用药膜法测定阿维菌素、高效氯氟氰菊酯、吡虫啉对梨小食心虫的室内毒性,旨在挖掘与杀虫剂解毒代谢相关基因,为进一步研究梨小食心虫解毒代谢机制奠定基础.根据生物测定结果,分别将3种杀虫剂原药用丙酮稀释至LC10、LC30、LC50 浓度,并将健康成虫放入带有杀虫剂薄膜的玻璃瓶 24 h,收集存活的成虫,-80℃保存备用.采用Illumina HiSeq 2000进行高通量测序,获得的非重复序列基因(Unigene),使用NCBI比对工具BLAST分别与NR、NT、SWISS-PROT、Pfam、GO、KOG、KEGG数据库进行比对,获得相应的注释信息;进一步采用生物信息学方法筛选差异表达的解毒酶基因.结果表明,从转录组中共获得101 873条Unigenes,平均长度为1 992 bp,在NR、NT、SWISS-PROT、Pfam、KEGG、KOG、GO数据库比对,分别有57 209、39 186、43 749、46 168、46 678、42 247、27 486条Unigene获得注释.阿维菌素、吡虫啉、高效氯氟氰菊酯处理梨小食心虫后差异表达基因分别有825、641、1 391个,其中筛选到20个解毒代谢相关基因,包括4个羧酸酯酶基因、5个谷胱甘肽硫转移酶基因和11个细胞色素P450基因. |
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ISSN: | 1002-2481 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1002-2481.2023.11.01 |