黄芪治疗肾透明细胞癌作用机制的网络药理学分析

R737.11; 目的 基于生物信息方法分析黄芪治疗肾透明细胞癌(ccRCC)的有效成分及潜在作用机制.方法 通过TCMSP筛选黄芪的活性成分及作用靶点.利用OMIM、Genecards、PharmGkb、DrugBank及TTD数据库筛选ccRCC疾病靶点并与黄芪作用靶点进行交集,获得黄芪治疗ccRCC的靶点.构建药物—成分—靶点—疾病网络图,筛选黄芪治疗ccRCC的核心成分.用Cytoscape3.8.0软件、STRING数据库分别建立黄芪治疗ccRCC靶点的蛋白质相互作用网络及可视化图,筛选黄芪治疗ccRCC的核心靶点.借助R语言和Bioconductor软件包对黄芪治疗ccRCC的靶点...

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Published in山东医药 Vol. 62; no. 32; pp. 26 - 31
Main Authors 赵凯, 张宗亮, 尹心宝, 王振林, 朱冠群, 王科
Format Magazine Article
LanguageChinese
Published 辽宁中医药大学研究生学院,沈阳116600%青岛大学附属医院泌尿外科 2022
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ISSN1002-266X
DOI10.3969/j.issn.1002-266X.2022.32.006

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Summary:R737.11; 目的 基于生物信息方法分析黄芪治疗肾透明细胞癌(ccRCC)的有效成分及潜在作用机制.方法 通过TCMSP筛选黄芪的活性成分及作用靶点.利用OMIM、Genecards、PharmGkb、DrugBank及TTD数据库筛选ccRCC疾病靶点并与黄芪作用靶点进行交集,获得黄芪治疗ccRCC的靶点.构建药物—成分—靶点—疾病网络图,筛选黄芪治疗ccRCC的核心成分.用Cytoscape3.8.0软件、STRING数据库分别建立黄芪治疗ccRCC靶点的蛋白质相互作用网络及可视化图,筛选黄芪治疗ccRCC的核心靶点.借助R语言和Bioconductor软件包对黄芪治疗ccRCC的靶点进行KEGG、GO富集分析.采用分子对接技术验证黄芪核心活性成分与核心靶点的作用强度.结果 筛选得到黄芪活性成分21个,共有395个潜在作用靶点,药物—疾病交集靶点180个,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、黄芪皂苷、芒柄花素、异鼠李素等,核心靶点有转录活化因子(JUN)、肿瘤蛋白P53(TP53)、苏氨酸激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等.KEGG、GO通路富集分析显示,黄芪治疗ccRCC的机制与调控PI3K-AKT、MAPK、AGE-RAGE、TNF等信号通路有关.分子对接实验显示,黄芪的5个核心活性成分与4个核心靶点均有较强的结合能力,其中黄芪皂苷与AKT1结合最紧密.结论 黄芪治疗ccRCC的活性成分有槲皮素、山柰酚、黄芪皂苷、芒柄花素、异鼠李素等,可能通过作用于JUN、TP53、AKT1、MAPK14等靶点,参与PI3K-AKT等信号通路,发挥调节机体免疫功能及影响细胞增殖、分化、凋亡、迁移等,从而达到治疗ccRCC的效果.
ISSN:1002-266X
DOI:10.3969/j.issn.1002-266X.2022.32.006