刺葡萄MYB基因家族鉴定及其在不同光质下的表达模式分析

S663.1%Q786; MYB转录因子是植物生长发育和次生代谢中重要的调控因子,对花青素的生物合成有重要调控作用.本研究从刺葡萄(Vitis davidii)愈伤组织转录组数据鉴定并克隆出9个VdMYB家族基因,并利用生物信息学方法分析和预测其结构和功能,同时分析其在不同光质诱导下的表达模式.基因序列分析结果显示大部分MYB基因包括3个外显子和2个内含子;蛋白质理化性质分析表明,VdMYBs氨基酸残基数目为216～335个,相对分子量大小为24.09～36.17 kD,等电点为5.42～9.58;进化树分析表明,9个VdMYBs被划分为6个组群,预测分别定位于细胞质、线粒体和细胞核中;启动子...

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Published in农业生物技术学报 Vol. 31; no. 2; pp. 298 - 310
Main Authors 阙秋霞, 赖恭梯, 潘若, 张静, 贺丽媛, 赖谱富, 王琦, 高慧颖, 陈桂信, 赖呈纯
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 福建省农业科学院农业工程技术研究所,福州350003%福建省农业科学院农业工程技术研究所,福州350003%福建农林大学园艺学院,福州350002 2023
福建农林大学园艺学院,福州350002
Subjects
光质
表达分析
刺葡萄
愈伤组织
MYB转录因子
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Summary:S663.1%Q786; MYB转录因子是植物生长发育和次生代谢中重要的调控因子,对花青素的生物合成有重要调控作用.本研究从刺葡萄(Vitis davidii)愈伤组织转录组数据鉴定并克隆出9个VdMYB家族基因,并利用生物信息学方法分析和预测其结构和功能,同时分析其在不同光质诱导下的表达模式.基因序列分析结果显示大部分MYB基因包括3个外显子和2个内含子;蛋白质理化性质分析表明,VdMYBs氨基酸残基数目为216～335个,相对分子量大小为24.09～36.17 kD,等电点为5.42～9.58;进化树分析表明,9个VdMYBs被划分为6个组群,预测分别定位于细胞质、线粒体和细胞核中;启动子顺式作用元件预测发现,9个VdMYB启动子序列中均有大量光响应等多种生物/非生物响应元件.qRT-PCR分析表明,光质显著影响VdMYBs的表达,不同光质作用下,VdMYBs基因响应模式与结构特征相对应;VdMYB31/VdMYBB1和VdMYB4A分别作为正负调控因子参与花青素生物合成.本研究为进一步解析MYB基因通过响应光信号参与调控刺葡萄愈伤组织花青素生物合成的分子机制提供理论参考.
ISSN:1674-7968
DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.02.008