猪VRTN基因SINE转座子插入多态与生长和繁殖性状的关联分析

S828.8; 椎骨发育相关基因(vertebrae development associated,VRTN)是动物椎骨发育的重要调控基因,研究表明猪(Sus scrofa domesticus)VRTN基因中存在一个短散在重复序列(short interspersed repeated sequence,SINE)的插入多态,该多态可能与猪的脊椎数关联.本研究通过PCR检测、性状关联分析和生物信息学分析等研究了SINE插入多态在不同品种间的分布及其对猪生长和繁殖性状的影响.结果表明,引入品种SINE+频率高于培育猪种和中国地方猪种,大白猪SINE+/+个体100 kg体重日龄显著高于SINE...

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Published in农业生物技术学报 Vol. 27; no. 3; pp. 464 - 470
Main Authors 陈伟, 陈才, 王宵燕, 张丽, 王伟, 沈丹, 王赛赛, 高波, 宋成义
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 扬州大学动物转座组和基因组研究所/动物科学与技术学院,扬州,225009 2019
Subjects
大白猪
关联分析
椎骨发育相关(VRTN)基因
短散在重复序列(SINE)
多态性
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Summary:S828.8; 椎骨发育相关基因(vertebrae development associated,VRTN)是动物椎骨发育的重要调控基因,研究表明猪(Sus scrofa domesticus)VRTN基因中存在一个短散在重复序列(short interspersed repeated sequence,SINE)的插入多态,该多态可能与猪的脊椎数关联.本研究通过PCR检测、性状关联分析和生物信息学分析等研究了SINE插入多态在不同品种间的分布及其对猪生长和繁殖性状的影响.结果表明,引入品种SINE+频率高于培育猪种和中国地方猪种,大白猪SINE+/+个体100 kg体重日龄显著高于SINE-/-个体(P＜0.05),大白猪SINE+/+个体眼肌面积显著低于SINE-/-个体(P＜0.05).产活仔数等繁殖性状与SINE插入多态无显著关联.经与表达序列标签(expressed sequence tag,EST)等数据库序列比对未发现SINE与VRTN基因形成融合转录本.本研究表明VRTN基因中SINE插入多态可能与猪生长速度和瘦肉率有关联,此结果为该分子标记在猪分子育种中的应用提供了参考.
ISSN:1674-7968
DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2019.03.010