基于转录组分析不同温度下池蝶蚌性别相关基因的表达

Q959.215; 采用Pacbio三代和Illumina二代测序技术对不同温度(15℃,20℃,25℃,30℃,33℃)条件下养殖的30月龄池蝶蚌性腺组织进行转录组分析.通过差异分析获得各个温度下雌雄对比组的差异基因,数量分别为6311,3013,6673,6798和5685个.其中在20℃和33℃下差异基因数量最少.差异表达基KEGG富集显示,25℃条件下出现卵母细胞的有丝分裂,细胞周期和notch信号通路等雌性相关活动.对五个温度处理组之间的差异表达基因进行组间比较,发现含有802个共同表达差异的基因,其中鉴定到wnt4,rspo1,fem1和tra1等4个性别决定相关基因.在qRT-P...

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Published in南昌大学学报（理科版） Vol. 45; no. 5; pp. 502 - 510
Main Authors 曾起, 胡蓓娟, 徐红琴, 洪一江
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 南昌大学 江西省水产动物资源与利用重点实验室,南昌 330031 2021
南昌大学 生命科学学院,南昌 330031
Subjects
池蝶蚌;转录组;性别决定;性腺;差异表达基因
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ISSN1006-0464
DOI10.3969/j.issn.1006-0464.2021.05.013

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Summary:Q959.215; 采用Pacbio三代和Illumina二代测序技术对不同温度(15℃,20℃,25℃,30℃,33℃)条件下养殖的30月龄池蝶蚌性腺组织进行转录组分析.通过差异分析获得各个温度下雌雄对比组的差异基因,数量分别为6311,3013,6673,6798和5685个.其中在20℃和33℃下差异基因数量最少.差异表达基KEGG富集显示,25℃条件下出现卵母细胞的有丝分裂,细胞周期和notch信号通路等雌性相关活动.对五个温度处理组之间的差异表达基因进行组间比较,发现含有802个共同表达差异的基因,其中鉴定到wnt4,rspo1,fem1和tra1等4个性别决定相关基因.在qRT-PCR和转录组数据中,各温度下wnt4,rspo1的表达水平雌性均显著(P<0.01)高于雄性;而fem1,tra1相反.根据wnt4,rspo1,fem1和tra1在不同温度下的相对表达情况和差异基因的KEGG富集结果表明,25℃以上更利于雌性发育,其发育机制还有待深入研究.
ISSN:1006-0464
DOI:10.3969/j.issn.1006-0464.2021.05.013