甘薯肉桂酸?4?羟化酶基因克隆及序列分析

Q943.2; 肉桂酸?4?羟化酶(Cinnamic acid?4?hydroxylase, C4H,EC 1.14.13.11)是苯丙烷途径中第二步反应酶,同时也是花色素苷前体生物合成途径中关键酶.该研究根据植物C4H的同源序列设计引物,通过RT?PCR结合RACE 的方法,在紫色甘薯中获得了与其相应的 C4H 基因,命名为 IbC4H(GenBank 登录号GQ373157).结果表明:(1)序列分析表明IbC4H长1668 bp,编码505个氨基酸,该氨基酸序列与其cDNA序列与IbC4H蛋白与马铃薯C4H蛋白序列最为接近,与苹果、黑莓、大阿米芹、油菜一致性很高,均在70%以上.(2)二...

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Published in广西植物 Vol. 38; no. 4; pp. 501 - 508
Main Authors 张华玲, 刘绪, 杨春贤, 黄元射, 傅玉凡, 张启堂
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 成都师范学院 化学与生命科学学院,成都,611130%西南大学 生命科学学院,重庆市甘薯工程技术研究中心,重庆400715%安顺学院 农学院,贵州 安顺,561000 2018
Subjects
sweet potato
gene cloning
序列分析
甘薯
sequence analysis
肉桂酸?4?羟化酶
cinnamic acid?4?hydroxylase
基因克隆
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ISSN1000-3142
DOI10.11931/guihaia.gxzw201703031

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Summary:Q943.2; 肉桂酸?4?羟化酶(Cinnamic acid?4?hydroxylase, C4H,EC 1.14.13.11)是苯丙烷途径中第二步反应酶,同时也是花色素苷前体生物合成途径中关键酶.该研究根据植物C4H的同源序列设计引物,通过RT?PCR结合RACE 的方法,在紫色甘薯中获得了与其相应的 C4H 基因,命名为 IbC4H(GenBank 登录号GQ373157).结果表明:(1)序列分析表明IbC4H长1668 bp,编码505个氨基酸,该氨基酸序列与其cDNA序列与IbC4H蛋白与马铃薯C4H蛋白序列最为接近,与苹果、黑莓、大阿米芹、油菜一致性很高,均在70%以上.(2)二级结构预测表明α?螺旋和无规则卷曲是IbC4H蛋白最大量的结构元件,而延伸链则散布于整个蛋白中.(3)三维结构建模预测,IbC4H蛋白具备细胞色素P450氧和铁离子结合位点等典型的C4H结构.该研究结果为进一步了解花色素苷生物合成途径中的作用奠定了基础,也为花青素生物合成分子机理和代谢调控提供了靶位点和理论参考.
ISSN:1000-3142
DOI:10.11931/guihaia.gxzw201703031