色瓦绵羊GPIHBP1基因克隆及其组织表达特征分析

S826.89; [目的]克隆色瓦绵羊乳腺组织糖基化磷脂酰肌醇锚定高密度脂蛋白结合蛋白1基因(GPIHBP1),明确其生物信息学特性及组织表达分布特征,为揭示GPIHBP1基因影响绵羊产奶性状的作用机制提供参考依据.[方法]克隆色瓦绵羊GPIHBP1基因编码区(CDS)序列,通过ProtPara、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、TMHMM-2.0等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测该基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等8个组织中的表达情况.[结果]色瓦绵羊GPIHBP1基因CDS序列长519 bp,共编码172个氨基酸残基,...

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Published in南方农业学报 Vol. 55; no. 1; pp. 235 - 242
Main Authors 潘君茹, 李蕊, 张馨, 仁青措姆, 孙宇, 杨井泉, 张贞贞, 陈华丽, 赵旺生, 宋天增
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010%西藏农牧科学院畜牧兽医研究所,西藏拉萨 850009%西藏农牧科学院畜牧兽医研究所,西藏拉萨 850009 2024
河南农业大学动物科技学院,河南郑州 450002%新疆农垦科学院畜牧兽医研究所,新疆石河子 832000
Subjects
lactation regulation
产奶性状
GPIHBP1 gene
milk production traits
泌乳调控
色瓦绵羊
mammary gland
乳腺
GPIHBP1基因
Sewa sheep
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ISSN2095-1191
DOI10.3969/j.issn.2095-1191.2024.01.024

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Summary:S826.89; [目的]克隆色瓦绵羊乳腺组织糖基化磷脂酰肌醇锚定高密度脂蛋白结合蛋白1基因(GPIHBP1),明确其生物信息学特性及组织表达分布特征,为揭示GPIHBP1基因影响绵羊产奶性状的作用机制提供参考依据.[方法]克隆色瓦绵羊GPIHBP1基因编码区(CDS)序列,通过ProtPara、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、TMHMM-2.0等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测该基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等8个组织中的表达情况.[结果]色瓦绵羊GPIHBP1基因CDS序列长519 bp,共编码172个氨基酸残基,与山羊GPIHBP1氨基酸序列(XM 018058666.1)比对,有4处氨基酸发生突变(32A→P、52V→A、130S→N和170M→V);色瓦绵羊GPIHBP1蛋白分子量为18063.87 Da,理论等电点(pI)为4.29,不存在跨膜螺旋结构,但存在信号肽(位于第20～21位氨基酸处),是一种细胞外的酸性亲水性蛋白.色瓦绵羊GPIHBP 1蛋白存在12个磷酸化位点(6个丝氨酸磷酸化位点,5个苏氨酸磷酸化位点,1个酪氨酸磷酸化位点),其二级结构以无规则卷曲状态(占55.07％)为主,其次是α-螺旋(占35.47％),延伸链、β-转角分别占5.81％和4.65％.GPIHBP1基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等8个组织中均有表达,以乳腺中的相对表达量最高,其次是心脏和肝脏,均极显著高于肌肉中的相对表达量(P＜0.01).[结论]GPIHBP1基因在色瓦绵羊不同组织中均有表达,且以乳腺中的相对表达量最高,可能与乳脂相关基因表达的增减有关,其中,GPIHBP 1基因与LPL基因共同作用而参与绵羊泌乳调控.
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2024.01.024