云南瘤蚱线粒体基因组特征与蚱总科系统发育分析

S433.2%Q963; [目的]通过分析云南瘤蚱(Thoradonta yunnana)线粒体基因组结构特征,重建蚱总科系统发育关系,为进一步明确蚱总科各类群间的亲缘关系和进化位置提供理论依据.[方法]通过Illumina HiSeq 2500测序平台的二代测序技术对云南瘤蚱线粒体基因组进行测序,并结合已有的23种蚱类昆虫及2种蚤蝼科昆虫的线粒体蛋白编码基因(Protein-coding genes,PCGs)分别利用最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)构建蚱总科系统发育关系.[结果]云南瘤蚱线粒体基因组全长17859 bp,包括2个rRNA基因、22个tRNA基因、13个PCGs及一段...

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Published in南方农业学报 Vol. 54; no. 5; pp. 1303 - 1316
Main Authors 韦春梦, 陈亚珍, 刘静, 邓维安, 李晓东
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 河池学院化学与生物工程学院,广西河池 546300%广西师范大学/珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室,广西桂林 541006 2023
Subjects
蚱总科
线粒体基因组
Tetrigoidea
系统发育分析
Thoradonta yunnana
全序列测定
mitochondrial genome
phylogeny
complete sequence determination
云南瘤蚱
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ISSN2095-1191
DOI10.3969/j.issn.2095-1191.2023.05.004

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Summary:S433.2%Q963; [目的]通过分析云南瘤蚱(Thoradonta yunnana)线粒体基因组结构特征,重建蚱总科系统发育关系,为进一步明确蚱总科各类群间的亲缘关系和进化位置提供理论依据.[方法]通过Illumina HiSeq 2500测序平台的二代测序技术对云南瘤蚱线粒体基因组进行测序,并结合已有的23种蚱类昆虫及2种蚤蝼科昆虫的线粒体蛋白编码基因(Protein-coding genes,PCGs)分别利用最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)构建蚱总科系统发育关系.[结果]云南瘤蚱线粒体基因组全长17859 bp,包括2个rRNA基因、22个tRNA基因、13个PCGs及一段非编码控制区.13个PCGs中,除nad6基因以TTG为起始密码子、nad5基因以不完整的T为终止密码子外,其余PCGs均以ATN作为起始密码子且以完整的TAA或TAG密码子终止.22个tRNA基因中,仅trnS1基因缺少DHU臂,其余基因均能折叠成三叶草二级结构.在云南瘤蚱线粒体基因组控制区中共发现6种重复序列,重复单元长度在29～204 bp不等.基于13个PCGs构建的ML法和BI法系统发育进化树拓扑结构基本一致,股沟蚱科和三棱角蚱科位于系统发育进化树的基部,属于较为原始的类群;刺翼蚱科、枝背蚱科及短翼蚱科位于发育进化树中部,属于中间类群;蚱亚科所有物种聚为一支,位于发育进化树顶部,属于较进化类群.[结论]研究结果支持蚱亚科为单系群,刺翼蚱科为并系群的观点,并在一定程度上验证了股沟蚱科属于较原始类群,蚱亚科属于较进化类群的观点.
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.05.004