海马齿根系响应盐胁迫的转录组分析

• Published in: 南方农业学报 Vol. 53; no. 3; pp. 693 - 703
• Main Authors: 李卫锦, 钟才荣, 张颖, 袁长春, 李仁茂
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 岭南师范学院生命科学与技术学院 广东湛江 524048%海南省林业科学研究院 海南海口 571100 2022
• Subjects: 海马齿; 盐胁迫; 根; 耐盐基因; 转录组
• ISSN: 2095-1191
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.03.011

S156.4; [目的]对盐胁迫下海马齿根系进行转录组测序分析,挖掘海马齿根系耐盐相关基因,为揭示海马齿耐盐的分子机制提供参考.[方法]利用Illumina测序技术对0 mmol/L NaCl(对照组)和400 mmol/L NaCl胁迫处理(盐胁迫处理组)下的海马齿根系进行转录组测序分析,从中筛选出差异表达基因,选取13个基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,以验证转录组数据的可靠性.[结果]在海马齿根系转录组中共鉴定出305145个转录本,平均长度为622 bp,其中,对照组有146177个长度>300 bp的转录本,盐胁迫处理组有72173个长度>300 bp的转录本;共有65535条Unigenes在Nr、GO、Swiss-Prot、COG和KEGG五大数据库注释成功,占Unigenes总数的52.36％.对照组和盐胁迫处理组共有65535个差异Unigenes,其中,有182个热休克蛋白基因.对照组和盐胁迫处理组间共有24042个差异表达基因,从中选取13个基因进行qRT-PCR检测,结果显示,9个基因表达上调,其余4个基因表达下调,与转录组测序结果一致.24042个差异表达基因中,共有10106个显著差异基因富集到129条代谢通路,其中富集程度排名前10的代谢途径为核糖体、次级代谢生物合成、RNA转运、内吞作用、剪接体、甘油磷脂代谢、内质网加工、吞噬、醚脂类代谢和植物-病原体相互作用,参与盐胁迫相关的硫代谢、脯氨酸积累、活性氧(ROS)代谢、与盐胁迫相关的钙信号通路和过氧化氢代谢等途径的差异基因上调.[结论]在盐胁迫下海马齿差异表达基因如小分子量热激蛋白基因、抗氧化酶相关基因及与离子交换相关基因发挥了重要调控作用.