不同桑树品种响应干旱胁迫的比较转录组学分析

• Published in: 南方农业学报 Vol. 53; no. 3; pp. 684 - 692
• Main Authors: 曾睿, 任迎虹, 祁伟亮, 黄仁维, 李恋龙, 李鑫鑫, 王飞, 赵比黑
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 成都师范学院化学与生命科学学院,四川成都 611130 2022
• Subjects: 差异表达基因; 抗旱性; 干旱胁迫; 桑树; 转录组

S888.2; [目的]发掘响应干旱胁迫的关键抗旱基因,从转录水平上揭示桑树的抗旱分子机制,为后续开展桑树分子抗旱性育种工作提供科学依据.[方法]以干旱敏感性品种德果1号和耐旱性品种湖桑32号为研究对象,通过盆栽种植方式开展干旱胁迫及复水处理试验,采集24个桑叶样本提取总RNA后构建cDNA文库,在Illumina HiSeqTM 4000测序平台上进行高通量测序,并结合生物信息学对相关基因进行注释分析.[结果]经转录组测序,各样本的Clean reads范围为45723096～67280168条,有效碱基数(Clean bases)集中在6.86～10.09 Gb,GC含量在44.84％～4...