葡萄CR4类受体激酶基因家族的鉴定及表达分析

S663.1; [目的]对葡萄属欧亚种群黑比诺葡萄(Vitis vinifera L.'Pinot Noir')和东亚种群山葡萄(V.amurensis)基因组中CRINKLY4类受体激酶(CR4)家族成员进行生物信息学分析及VvCR4在不同组织及胁迫下的表达分析,为CR4基因功能研究和应用提供理论依据.[方法]运用生物信息学工具对2种葡萄基因组中CR4基因家族成员进行鉴定及分析,利用基因芯片数据分析欧亚种葡萄该家族在不同组织中的表达情况,并通过qRT-PCR分析黑比诺葡萄CR4成员在不同非生物胁迫下的表达模式.[结果]共鉴定出5个VvCR4成员和4个VaCR4成员,分为3...

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Published in果树学报 Vol. 39; no. 4; pp. 518 - 531
Main Authors 李婉莹, 马乃膺, 左存武, 毛娟, 李文芳, 陈佰鸿, 褚明宇
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 甘肃农业大学园艺学院,兰州730070 2022
Subjects
基因家族
葡萄
CR4
表达分析
生物信息学分析
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ISSN1009-9980
DOI10.13925/j.cnki.gsxb.20210389

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Summary:S663.1; [目的]对葡萄属欧亚种群黑比诺葡萄(Vitis vinifera L.'Pinot Noir')和东亚种群山葡萄(V.amurensis)基因组中CRINKLY4类受体激酶(CR4)家族成员进行生物信息学分析及VvCR4在不同组织及胁迫下的表达分析,为CR4基因功能研究和应用提供理论依据.[方法]运用生物信息学工具对2种葡萄基因组中CR4基因家族成员进行鉴定及分析,利用基因芯片数据分析欧亚种葡萄该家族在不同组织中的表达情况,并通过qRT-PCR分析黑比诺葡萄CR4成员在不同非生物胁迫下的表达模式.[结果]共鉴定出5个VvCR4成员和4个VaCR4成员,分为3个亚组,同一种葡萄CR4基因结构高度保守,所有成员启动子区均存在多种植物激素和逆境胁迫相关的响应元件.VvCR4在不同时期的花与果实发育中表达量相对较高;qRT-PCR表明VvCR4成员对MJ、SA、ABA、4℃C的胁迫响应明显,大多为上调表达且出现表达高峰的时间点因基因和胁迫的差异而不同.[结论]VvCR4成员在MJ处理下呈显著正调控模式,可能与MJ信号转导密切相关,在SA、ABA、Flg22与低温胁迫诱导下,VvCR4.1、VvCR4.2、VvCR4.3、VvCR4.4都有不同程度的响应,VvCR4.5响应不明显.
ISSN:1009-9980
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20210389