环状RNA在口腔白斑和口腔扁平苔藓中的共同表达

R78; 目的 探讨环状RNA在口腔白斑(oral leukoplakia,OLK)和口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)疾病发生发展中的共同表达,为研究OLK与OLP的发病机制及癌变机制提供基础.方法 本研究获得医院伦理审批.采用高通量测序技术检测OLK、OLP、口腔鳞状细胞癌和正常口腔黏膜组织中差异表达的circRNA,采用qRT-PCR、酶耐受实验和sanger测序筛选并验证OLK与OLP中共同显著差异表达circRNA,并对关键circRNA扩大样本量验证;采用GO和KEGG富集分析差异circRNA可能涉及的生物学过程及信号通路;采用TargetScan与Mi...

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Published in口腔疾病防治 Vol. 31; no. 11; pp. 774 - 785
Main Authors 杨靖雯, 宋雨翰, 徐思明, 葛姝云, 周海文
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔黏膜病科,上海交通大学口腔医学院,国家口腔医学中心,国家口腔疾病临床医学研究中心,上海市口腔医学重点实验室,上海市口腔医学研究所,上海 200011 2023
Subjects
癌变
circRNA
malignant transformation
biomarkers
生物标志物
高通量测序
oral leukoplakia
oral potentially malignant disor-ders
环状RNA
口腔黏膜潜在恶性疾病
oral lichen planus
口腔扁平苔藓
口腔白斑病
circHLA-C
high-throughput sequencing
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Summary:R78; 目的 探讨环状RNA在口腔白斑(oral leukoplakia,OLK)和口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)疾病发生发展中的共同表达,为研究OLK与OLP的发病机制及癌变机制提供基础.方法 本研究获得医院伦理审批.采用高通量测序技术检测OLK、OLP、口腔鳞状细胞癌和正常口腔黏膜组织中差异表达的circRNA,采用qRT-PCR、酶耐受实验和sanger测序筛选并验证OLK与OLP中共同显著差异表达circRNA,并对关键circRNA扩大样本量验证;采用GO和KEGG富集分析差异circRNA可能涉及的生物学过程及信号通路;采用TargetScan与MiRanda预测circRNA下游的miRNA并绘制ceRNA网络.结果 OLK与OLP共同差异表达的circRNA共49个,包括30个上调和19个下调的circRNA;经验证,筛选的3个上调circRNA(circHLA-C,circTTN,circRNF13)和2个下调cir-cRNA(circSEPN2,circALDH3A2)表达趋势与测序结果一致.其中circHLA-C是具有反式剪接位点的关键cir-cRNA,经扩大样本量验证,circHLA-C在OLK与OLP中显著上调.ROC曲线分析显示,OLK中circHLA-C曲线下面积为 0.955,OLP中circHLA-C曲线下面积为 0.988.GO功能富集显示与免疫功能生物学过程密切相关,KEGG通路分析中富集分数最高的信号通路是"自然杀伤细胞介导的细胞毒性",HLA-C在这些通路中显著富集,ceRNA网络分析表明circHLA-C可能与多种癌症相关miRNA相互作用,如hsa-miR-26a-5p、hsa-miR-129-5p和hsa-miR-29a-3p.结论 OLK与OLP存在相同差异表达的circRNA,circHLA-C是OLK与OLP共有的最显著上调的cir-cRNA;circHLA-C可能会成为OLP与OLK诊断和预后的潜在生物标志物.
ISSN:2096-1456
2097-0234
DOI:10.12016/j.issn.2096-1456.2023.11.003