基于细菌群落鉴别裸鼠生前损伤和死后损伤

• Published in: 法医学杂志 Vol. 40; no. 5; pp. 430 - 438
• Main Authors: 郑欣, 邱越, 李志刚, 向青青, 汪冠三, 石河, 徐曲毅, 隋鹏, 马雁兵, 刘超, 陈立方, 赵建
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 昆明医科大学法医学院,云南 昆明 650500%广州市刑事科学技术研究所 法医病理学公安部重点实验室,广东 广州 510442%黑龙江省公安厅刑事技术总队,黑龙江 哈尔滨 150006%广东省毒品实验技术中心 国家毒品实验室广东分中心,广东 广州 510230%广州市刑事科学技术研究所 法医病理学公安部重点实验室,广东 广州 510442 2024; 中山大学中山医学院法医学系 广东省法医学转化医学工程技术研究中心,广东 广州 510080
• Subjects: 菌落; 16S rRNA; BALB/c nude mice; colony; microbiology; postmortem injury; 微生物学; BALB/c裸鼠; 生前损伤; forensic pathology; antemortem injury; 死后损伤; 法医病理学
• ISSN: 1004-5619
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2023.430806

R89%DF795.1%D919.1; 目的 建立裸鼠的生前损伤和死后损伤模型,观察损伤后不同时间点创口的形态学和细菌群落变化,分析生前损伤和死后损伤的差异.方法 建立48只BALB/c裸鼠的腹部损伤模型,分为生前损伤、死后4 h损伤和死后72 h损伤组,观察损伤形成后第1、3、5、8、11、15天的大体表现和组织病理学改变,并通过16S rRNA测序技术分析创口的细菌群落.使用QIIME 2软件计算Shannon指数和Observed species指数,采用Kruskal-Wallis检验比较组间的α多样性;使用R v4.3.0软件计算样本间Jaccard相似系数并应用于主坐标分析,以展示样本间差异,采用置换多元方差分析检验菌群构成的组间差异,并计算R2值.结果 损伤形成后第8、11、15天,形态学检验已经难以区分生前损伤和死后损伤,生前损伤组和死后72 h损伤组的Shannon指数、Observed species指数差异具有统计学意义,细菌群落的Jaccard相似系数差异具有统计学意义,置换多元方差分析的R2值随时间的延长逐渐升高(0.22～0.61).结论 通过分析创口细菌群落,可识别和比较不同时间点创口中的微生物组成,为鉴别生前损伤和死后损伤提供了新的视角和方法,具有良好的应用前景.