亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱法鉴定水稻蛋白质

• Published in: 分析化学 Vol. 46; no. 5; pp. 650 - 657
• Main Authors: 高欢欢, 马有宁, 林晓燕, 柴爽爽, 秦美玲, 张涵彤, 何巧, 陈铭学
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 中国水稻研究所农业部稻米及制品质量监督检验测试中心,杭州310006 2018; 浙江工业大学化学工程学院,杭州,310014%中国水稻研究所农业部稻米及制品质量监督检验测试中心,杭州,310006%浙江工业大学化学工程学院,杭州310014
• Subjects: 亲水作用-反相二维液相色谱; 纳升级液相色谱串联质谱; Hydrophilic interaction-reversed-phase two-dimensional liquid chromatography; Nanoflow reversed-phase liquid chromatography-tandem mass spectrometry; 正交性; Orthogonality; 水稻叶片; Rice leaves; 蛋白质; Protein
• ISSN: 0253-3820
• DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.171398

建立了亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱分析水稻叶片蛋白质组学的方法.利用标准肽段系统分析了液相色谱流动相酸碱度对二维亲水作用-反相色谱系统正交性的影响.结果表明,第一维亲水作用色谱在碱性 (pH 9.3) 和第二维反相色谱在酸性 (pH 3.3) 的条件下,正交性最佳(R2=0.34113).在此基础上,结合馏分收集技术进一步评价了本测试系统在水稻叶片蛋白质分析中的正交性.结果表明,在所有馏分收集组分中,鉴定次数小于2次的水稻叶片肽段占总肽段数目的50%以上,且一维液相色谱馏分收集的肽段在第二维色谱及质谱分离分析中,可以较好地分布在不同时间段的洗脱窗口,表明本研究建立的亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱结合馏分收集技术在复杂水稻叶片蛋白质分离鉴定中可提供良好的的分离正交性.结合水稻蛋白质数据库检索,共鉴定出207345个肽段,归属于2930个蛋白质簇.