黄芪汤治疗慢传输型便秘的作用机制初探
R657.1; 目的 通过网络药理学、分子对接技术及免疫印迹试验,初步探讨黄芪汤治疗慢传输型便秘的作用机制.方法 使用TCMSP和SymMap数据库筛选黄芪汤的活性成分和潜在作用靶点,在GeneCards数据库和DisGeNET数据库中检索慢传输型便秘相关靶点,绘制韦恩图取黄芪汤与慢传输型便秘的交集靶点.使用Cytoscape软件绘制"中药-活性成分-靶点-疾病"网络图.使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络图,并筛选核心靶点.运用clusterProfiler包对核心靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集...
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Published in | 结直肠肛门外科 Vol. 30; no. 5; pp. 570 - 577 |
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Main Authors | , , , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
广州市黄埔区中六生物医学创新研究院 广东 广州 510655
2024
中山大学附属第六医院肛肠外科 广东 广州 510655 广东省结直肠盆底疾病研究重点实验室 广东 广州 510655 |
Subjects | |
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ISSN | 1674-0491 |
DOI | 10.19668/j.cnki.issn1674-0491.2024.05.010 |
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Summary: | R657.1; 目的 通过网络药理学、分子对接技术及免疫印迹试验,初步探讨黄芪汤治疗慢传输型便秘的作用机制.方法 使用TCMSP和SymMap数据库筛选黄芪汤的活性成分和潜在作用靶点,在GeneCards数据库和DisGeNET数据库中检索慢传输型便秘相关靶点,绘制韦恩图取黄芪汤与慢传输型便秘的交集靶点.使用Cytoscape软件绘制"中药-活性成分-靶点-疾病"网络图.使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络图,并筛选核心靶点.运用clusterProfiler包对核心靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析.使用AutoDock Vina进行分子对接,PyMOL可视化结果.通过免疫印迹试验检测脂多糖(LPS)+不同浓度的黄芪汤处理的LS174T细胞中p65和p-p65蛋白表达水平.结果 通过网络药理学分析得到黄芪汤活性成分174种,潜在作用靶点521个,慢传输型便秘相关靶点1041个,黄芪汤与慢传输型便秘的交集靶点84个."中药—活性成分—靶点—疾病"网络图显示,黄芪汤排名前5位的活性成分为乙酸、槲皮素、木犀草素、山奈酚、花生四烯酸.核心PPI网络图显示,黄芪汤治疗慢传输型便秘的核心靶点为IL6、IL1B、TNF、IL10、CCL2、ICAM1、TLR4、IFNG、IL1A、MMP9.转录相关靶点为 RELA、RB1、NFKBIA、STAT1、RUNX1T1、PPARG、PPARA、RUNX2、PGR、SREBF1.GO功能富集分析结果显示,交集基因主要富集在细菌来源的分子的反应、炎症反应的调控、细胞因子产生的正向调控等生物过程(BP)上,细胞因子受体结合、细胞因子活性等分子功能(MF)上,膜筏、膜微结构域等细胞成分(CC)上.KEGG功能富集分析结果显示,交集基因主要与TNF、MAPK、PI3K-Akt、NF-κB等信号通路有关.分子对接结果显示,黄芪汤的活性成分乙酸、槲皮素、木犀草素、山奈酚、花生四烯酸与p65蛋白具有较好的结合性.免疫印迹试验结果显示,LPS处理组的p-p65蛋白水平升高,用3个不同浓度的黄芪汤处理后,p-p65蛋白水平均降低.结论 慢传输型便秘的发生与NF-κB信号通路有关,黄芪汤可能通过降低p-p65蛋白水平抑制NF-κB信号通路,发挥治疗慢传输型便秘的作用. |
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ISSN: | 1674-0491 |
DOI: | 10.19668/j.cnki.issn1674-0491.2024.05.010 |