芥菜SBP-box基因家族全基因组鉴定与表达分析

S637; SBP-box作为植物特有转录因子家族,广泛参与植物生长发育调控与响应逆境胁迫.从芥菜全基因组中鉴定SBP-box基因家族,分析家族成员理化性质、序列特征、互作调控网络、进化关系及表达模式.结果表明,芥菜SBP-box共包含58个成员,均含有1个保守SBP结构域,启动子区域含有多种非生物胁迫响应与激素响应的顺式作用元件,BjuSBP-microRNA-靶基因构建复杂的调控网络,参与有机物生物合成、RNA代谢过程调控、花器官发育、营养相变化、细胞代谢调节等生物学过程.在低温胁迫下,BjuSBP1a、BjuSBP1b、BjuSBP1e、BjuSBP4l、BjuSBP4m等基因显著上调表...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in东北农业大学学报 Vol. 54; no. 8; pp. 1 - 16
Main Authors 杨巍, 赵丽芬, 杨娟, 唐兵, 付文苑, 王青青, 莫传园, 张宝会, 奥宁, 李裕荣, 李飞, 王天文, 邓英
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 贵州大学农学院,贵阳 550025%安顺学院农学院,贵州 安顺 561000 2023
贵州省园艺工程技术研究中心,贵阳 550006
贵州省园艺工程技术研究中心,贵阳 550006%贵州省农业科学院园艺研究所,贵阳 550006
贵州省农业科学院园艺研究所,贵阳 550006
Subjects
生物信息学
expression analysis
SBP-box transcription factor
芥菜
表达分析
bioinformatics
SBP-box转录因子
Brassica juncea L
Online AccessGet full text
ISSN1005-9369
DOI10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2023.08.001

Cover

More Information
Summary:S637; SBP-box作为植物特有转录因子家族,广泛参与植物生长发育调控与响应逆境胁迫.从芥菜全基因组中鉴定SBP-box基因家族,分析家族成员理化性质、序列特征、互作调控网络、进化关系及表达模式.结果表明,芥菜SBP-box共包含58个成员,均含有1个保守SBP结构域,启动子区域含有多种非生物胁迫响应与激素响应的顺式作用元件,BjuSBP-microRNA-靶基因构建复杂的调控网络,参与有机物生物合成、RNA代谢过程调控、花器官发育、营养相变化、细胞代谢调节等生物学过程.在低温胁迫下,BjuSBP1a、BjuSBP1b、BjuSBP1e、BjuSBP4l、BjuSBP4m等基因显著上调表达,在光胁迫下,大多数家族基因表达受抑制,其中BjuSBP1a、BjuSBP9d在两种胁迫下均上调表达,推断其在芥菜非生物胁迫应激反应中发挥功能作用,可作为培育芥菜抗逆新品种候选基因资源.
ISSN:1005-9369
DOI:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2023.08.001