不同发育阶段老山芹种子多组学联合分析

S647%Q819; 层积是解除老山芹种子休眠有效方法.为深入研究层积对老山芹种子休眠及萌发影响的分子机制,取未层积、子叶期胚及发芽种子作蛋白质组(TMT法)和代谢组(GC-TOF/MS法)测定与分析,比较筛选差异蛋白质和差异代谢物,运用生物信息学技术预测分析相关生物学功能并整合分析二者间关联性,Real-time PCR鉴定糖代谢相关通路关键酶基因表达谱.结果表明,与种子萌发相关差异蛋白包括HmBIP2、HmACT7、HmUDG4及HmACLB-2等;存在互作关系的差异蛋白多为核糖体蛋白;差异代谢物、存在关联关系的差异蛋白及差异代谢物显著富集于淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢等糖代谢通路中;大多数...

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Published in东北农业大学学报 Vol. 52; no. 10; pp. 32 - 46
Main Authors 李富恒, 张晓雯, 张永芳, 于萍, 张宏发
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 山西大同大学生命科学学院,山西 大同 037009%北京阅微基因技术股份有限公司,北京 100044 2021
东北农业大学生命科学学院,哈尔滨 150030%东北农业大学生命科学学院,哈尔滨 150030
Subjects
层积;老山芹种子;蛋白质组学;代谢组学;联合分析
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ISSN1005-9369
DOI10.3969/j.issn.1005-9369.2021.10.004

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Summary:S647%Q819; 层积是解除老山芹种子休眠有效方法.为深入研究层积对老山芹种子休眠及萌发影响的分子机制,取未层积、子叶期胚及发芽种子作蛋白质组(TMT法)和代谢组(GC-TOF/MS法)测定与分析,比较筛选差异蛋白质和差异代谢物,运用生物信息学技术预测分析相关生物学功能并整合分析二者间关联性,Real-time PCR鉴定糖代谢相关通路关键酶基因表达谱.结果表明,与种子萌发相关差异蛋白包括HmBIP2、HmACT7、HmUDG4及HmACLB-2等;存在互作关系的差异蛋白多为核糖体蛋白;差异代谢物、存在关联关系的差异蛋白及差异代谢物显著富集于淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢等糖代谢通路中;大多数糖代谢相关通路关键酶基因呈先降后升表达趋势.研究从差异蛋白质和差异代谢物功能角度进一步揭示老山芹种子后熟及萌发调控机制.
ISSN:1005-9369
DOI:10.3969/j.issn.1005-9369.2021.10.004