大豆GmPID基因生物信息学分析及克隆

S565.1; 利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树.结果表明, GmPID编码区cDNA长度为1 359 bp,编码452个氨基酸, GmPID编码的蛋白为碱性亲水性蛋白;分析其蛋白功能结构域发现,GmPID蛋白含有丝氨酸/苏氨酸激酶催化结构域,为PKc-like超家族成员;构建系统进化树发现其与密花豆亲缘较近.研究结果有利于深入研究大豆再生相关基因GmPID在大豆再生过程中的关键作用,为提高大豆...

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Published in东北农业大学学报 Vol. 51; no. 1; pp. 13 - 22
Main Authors 张超, 张勇, 满百膺, 伍应保, 张高阳, 张惠宁, 涂班策, 吕晶晶, 李思楠, 程鹏, 武小霞
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 东北农业大学农学院,哈尔滨 150030%上饶师范学院生命科学学院,江西 上饶,334001%东北农业大学农学院,哈尔滨,150030%东北农业大学农学院,哈尔滨 150030 2020
上饶师范学院生命科学学院,江西 上饶 334001
黑龙江省绿色食品科学研究院,哈尔滨 150030
Subjects
AGC激酶
生物信息学
大豆
再生
GmPID
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Summary:S565.1; 利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树.结果表明, GmPID编码区cDNA长度为1 359 bp,编码452个氨基酸, GmPID编码的蛋白为碱性亲水性蛋白;分析其蛋白功能结构域发现,GmPID蛋白含有丝氨酸/苏氨酸激酶催化结构域,为PKc-like超家族成员;构建系统进化树发现其与密花豆亲缘较近.研究结果有利于深入研究大豆再生相关基因GmPID在大豆再生过程中的关键作用,为提高大豆再生效率提供理论基础.
ISSN:1005-9369
DOI:10.3969/j.issn.1005-9369.2020.01.002