苋菜amaARF6基因克隆及其外源激素处理下在幼苗中响应分析

S636.4; 以‘大红’苋菜(Amaranthus tricolor L.‘Dahong’)为材料,根据实验室构建的苋菜转录组数据库(SRA:SSR924089～SSR924092),采用RT-PCR结合RACE技术克隆获得1条生长素响应因子ARF6基因cDNA全长序列,命名为amaARF6(登录号为MG581459).苋菜amaARF6基因cDNA全长3 758 bp,含一个2 697 bp开放阅读框,编码898个氨基酸.生物信息学分析表明,amaARF6包括生长素响应因子结构域和生长素功能位点,有ARF基因家族特有序列特征;系统进化树分析发现,amaARF6蛋白与同为石竹目甜菜BvARF...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in东北农业大学学报 Vol. 49; no. 5; pp. 24 - 32
Main Authors 潘君飞, 彭丽云, 赵春丽, 王晓, 张梓浩, 陈裕坤, 赖钟雄, 刘生财
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,350002 2018
Subjects
苋菜
exogenous hormones
amaARF6
expression analysis
外源激素
表达分析
Amaranthus tricolor L
生物信息学分析
bioinformatics analysis
Online AccessGet full text
ISSN1005-9369

Cover

More Information
Summary:S636.4; 以‘大红’苋菜(Amaranthus tricolor L.‘Dahong’)为材料,根据实验室构建的苋菜转录组数据库(SRA:SSR924089～SSR924092),采用RT-PCR结合RACE技术克隆获得1条生长素响应因子ARF6基因cDNA全长序列,命名为amaARF6(登录号为MG581459).苋菜amaARF6基因cDNA全长3 758 bp,含一个2 697 bp开放阅读框,编码898个氨基酸.生物信息学分析表明,amaARF6包括生长素响应因子结构域和生长素功能位点,有ARF基因家族特有序列特征;系统进化树分析发现,amaARF6蛋白与同为石竹目甜菜BvARF6蛋白进化距离最近,相似度高达100％.荧光定量PCR分析表明,苋菜幼苗在不同浓度2,4-D、IAA、IBA等生长素及不同浓度GA3和PP333处理下,amaARF6基因均受调控,且在2,4-D、IAA、IBA等生长素处理后表达上调,经GA3和PP333处理后表达下调.研究还发现,苋菜中甜菜红素累积受GA3和2,4-D抑制,PP333促进甜菜红素合成,amaARF6基因表达量在GA3和PP333处理下呈相反变化趋势.研究结果表明,amaARF6基因可能具备ARF家族正调控因子表达特征和功能,可能参与调控苋菜幼苗生长和甜菜红素合成.研究结果为揭示amaARF6基因在苋菜幼苗生长中作用奠定基础,为苋菜育种提供线索.
ISSN:1005-9369