加州鲈p65基因克隆及表达分析

S917.4; 从加州鲈(Micropterus salmoides)脑组织中克隆获得NF-κB家族中p65 基因的编码区序列,该基因cDNA全长 1 944 bp,ORF为1 899 bp,可编码632个氨基酸.理论分子质量为69.61 ku,理论等电点(PI)为 5.66,通过生信学分析工具对p65 基因蛋白结构进行分析,同时对其蛋白功能进行预测,结果显示:该基因不含有信号肽序列,同时不存在跨膜结构域,但存在1 个NF-κB家族保守的结构域.多序列比对结果显示,加州鲈(Micropterus salmoides)p65与小口黑鲈(Micropter us dolomieu)的相似度最高,达...

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Published in安徽农业科学 Vol. 52; no. 16; pp. 91 - 100
Main Authors 丘金珠, 唐怀庆, 宋海霞, 赵天珍, 梁富, 邓晓华, 梁莹, 宋长江
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中山市农产品质量安全检验所,广东中山 528400 2024
Subjects
生物信息学
组织表达分析
加州鲈
Micropterus salmoides
Organizational expression analysis
Bioinformatics
p65
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ISSN0517-6611
DOI10.3969/j.issn.0517-6611.2024.16.019

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Summary:S917.4; 从加州鲈(Micropterus salmoides)脑组织中克隆获得NF-κB家族中p65 基因的编码区序列,该基因cDNA全长 1 944 bp,ORF为1 899 bp,可编码632个氨基酸.理论分子质量为69.61 ku,理论等电点(PI)为 5.66,通过生信学分析工具对p65 基因蛋白结构进行分析,同时对其蛋白功能进行预测,结果显示:该基因不含有信号肽序列,同时不存在跨膜结构域,但存在1 个NF-κB家族保守的结构域.多序列比对结果显示,加州鲈(Micropterus salmoides)p65与小口黑鲈(Micropter us dolomieu)的相似度最高,达99.30%;构建系统进化树发现,加州鲈(Micropterus salmoides)p65与小口黑鲈(Micropter us dolomieu)聚为一支.通过qRT-PCR结果表明,加州鲈p65 基因在所取组织均有表达,在脑组织中表达量最高,其次是头肾、胸腺和心脏,在脾脏组织中的表达量最低.
ISSN:0517-6611
DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2024.16.019