Akut Miyeloid Lösemi Hastalarýnda "Peroksizom Proliferatör Aktive Edici Reseptör-Gama" Geninin Epigenetik Düzenlenmesi

• Published in: Türkiye klinikleri. Türkiye klinikeri journal of medical sciences. Tıp bilimleri dergisi Vol. 39; no. 4; pp. 375 - 380
• Main Authors: Şahin, Deniz Gören, Gündüz, Eren, Yurteri, Buket, Yeşilyurt, Ahmet, Andiç, Neslihan, Teke, Hava Üsküdar, Akay, Olga Meltem
• Format: Journal Article
• Language: Turkish
• Published: Balgat Ortadogu Reklam Tanitim Yayincilik Turizm Egitim Insaat Sanayi ve Ticaret A.S 01.07.2019
• Subjects: Deoxyribonucleic acid; DNA; DNA methylation; Epigenetics; Gene expression; Leukemia; Polymerase chain reaction
• ISSN: 1300-0292
• DOI: 10.5336/medsci.2019-66573

Amaç: Peroksizom proliferatör aktive edici reseptör (PPAR) gama; hücresel büyüme, farklılaşma ve apopitozisi düzenleyen nükleer hormon reseptör ailesinin bir üyesidir. Normal kemik iliğinde ve periferik CD34+ hücrelerde PPAR gama ifadesi mevcuttur. Akut miyeloid lösemi (AML)’de bu ifadenin azaldığını gösteren çalışmalar vardır. Ancak, bu azalmanın transkripsiyonel mi yoksa epigenetik mi olduğuna dair çalışma yoktur. Hipotezimiz, AML hastalarında PPAR gama ifadesinin azalmasının, bu gen bölgesinin aşırı metilasyonu sonucu olduğudur. Bu amaca yönelik olarak çalışmamızda, AML ve sağlıklı kontrol grubunda PPAR gama geninin ifadesi ve metilasyon düzeylerini araştırdık. Gereç veYöntemler: Çalışmaya yeni tanı konulmuş 31 AML hastası, 25 sağlıklı birey dâhil edildi. PPAR gama gen ifadesinin farklılığına gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) tekniği ile bakıldı. Aynı hastalarda Epitect bisülfit protokolü uygulanarak metilasyon spesifik PCR yapıldı. PPAR gama gen bölgesinde aşırı metilasyon olabilecek promoter bölgesine uygun primerler dizayn edildi. Ardından termal cycler ile bisülfit DNA dönüşümü yapıldı. Epitect HRM PCR protokülü ile PPAR gama genindeki metilasyon düzeyi ölçüldü. Bulgular: RT-PCR sonucunda AML hastalarında PPAR gama gen ifadesinin sağlıklı bireylere göre yaklaşık 1,5 kat kadar azaldığı tespit edildi. PPAR gama ifadesinin azaldığı gösterilen hastalarda metilasyon spesifik PCR ile PPAR gama geni promoter bölgesinin metilasyon durumu incelendiğinde, AML hastalarında aday gen bölgesinde metilasyonun anlamlı olarak arttığı (AML hastalarında %29 ve kontrol grubunda %8, p<0,001) tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda, kemik iliğindeki hematopoetik süreci düzenleyen genlerden biri olan PPAR gama geninin ifadesinin AML hastalarında anlamlı olarak azaldığı izlenmiştir. Bunun yanı sıra, bu gen ifadesinin baskılanmasından, genin promoter bölgesinin aşırı metilasyonunun sorumlu olabileceği gösterilmiştir.