SORTING METHOD USING BARCODED CHAMBERS FOR SINGLE CELL WORKFLOW

• Main Authors: ACOB, Ricelle Agbayani, LOPEZ-SALMERON, Vadir, JENSEN, Devon Joseph, AYER, Aruna, NGUYEN, Rosary Kim
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 27.06.2024
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Disclosed herein include systems, methods, compositions, and kits for methods of assigning the sequencing data of single cells to chambers. There are provided, in some embodiments, methods of associating sequencing data and phenotypic data of single cells. Disclosed herein include solid supports each comprising a plurality of oligonucleotide barcodes comprising a cell label sequence. Each cell label sequence can comprise predetermined chamber indexing subsequence(s). Oligonucleotide barcodes situated within the same chamber can comprise the same chamber indexing subsequence(s), and oligonucleotide barcodes situated within different chambers can comprise different chamber indexing subsequence(s). La divulgation concerne des systèmes, des procédés, des compositions et des kits pour des procédés d'attribution des données de séquençage de cellules uniques à des chambres. Dans certains modes de réalisation, la divulgation concerne des procédés d'association de données de séquençage et de données phénotypiques de cellules uniques. La divulgation concerne des supports solides comportant chacun une pluralité de codes-barres oligonucléotidiques comprenant une séquence d'étiquette de cellule. Chaque séquence d'étiquette de cellule peut comprendre une ou plusieurs sous-séquences d'indexation de chambre prédéterminées. Des codes-barres oligonucléotidiques situés à l'intérieur d'une même chambre peuvent comprendre une ou plusieurs sous-séquences d'indexation de chambre identiques, et des codes-barres oligonucléotidiques situés à l'intérieur de chambres différentes peuvent comprendre une ou plusieurs sous-séquences d'indexation de chambre différentes.