DETECTING METHYLCYTOSINE AND ITS DERIVATIVES USING S-ADENOSYL-L-METHIONINE ANALOGS (XSAMS)

• Main Authors: WU, Xiaolin, BRUSTAD, Eric, GORMLEY, Niall, SHULTZABERGER, Sarah
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 22.09.2022
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIREDCHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERSFROM A RACEMIC MIXTURE; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Examples provided herein are related to detecting methylcytosine and its derivatives using S- adenosyl-L-methionine analogs (xSAMs). Compositions and methods for performing such detection are disclosed. A target polynucleotide may include cytosine (C) and methylcytosine (mC). The method may include (a) protecting the C in the target polynucleotide from deamination; and (b) after step (a), deaminating the mC in the target polynucleotide to form thymine (T). Protecting the C from deamination may include adding a protective group to the 5 position of the C, e.g., using a methyltransferase enzyme that adds the first protective group from an xSAM. Des exemples de la présente invention concernent la détection de méthylcytosine et de ses dérivés à l'aide d'analogues de S-adénosyl-L-méthionine (xSAM). L'invention concerne également des compositions et des procédés pour réaliser une telle détection. Un polynucléotide cible peut comprendre de la cytosine (C) et de la méthylcytosine (mC). Le procédé peut comprendre les étapes suivantes : (a) protection de la C dans le polynucléotide cible contre la désamination ; et (b) après l'étape (a), désamination de la mC dans le polynucléotide cible pour former de la thymine (T). La protection de la C contre la désamination peut inclure l'ajout d'un groupe protecteur à la position 5 de la C, par exemple, en utilisant une enzyme méthyltransférase ajoutant le premier groupe protecteur à partir d'une xSAM.