NUCLEOSIDE-5'-OLIGOPHOSPHATES TAGGED WITH POSITIVELY-CHARGED POLYMERS, NANOPORES INCORPORATING NEGATIVE CHARGES, AND METHODS AND SYSTEMS USING THE SAME

• Main Authors: CRISALLI, Peter, KUCHELMEISTER, Hannes, PORTER, Marshall W, NIE, Rongxin, VARGAS, Adolfo, HILLRINGHAUS, Lars, SEIDEL, Christoph, KHAKSHOOR, Omid, BERGMANN, Frank, SHIN, Seong-Ho, TAING, Meng, AYER, Aruna
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 17.02.2022
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

The present disclosure relates to tagged nucleoside-5 '-oligophosphates having a positively charged polymer tag structure and components thereof. Such nucleoside- 5 '-oligophosphates are useful, for example, in nanopore-based sequencing-by-synthesis applications. Also disclosed herein are nanopore constructs engineered to have additional negatively-charged moieties in the channel of the nanopore. Such nanopores can be useful, for example, for providing a repellant force against template and/or primer nucleic acids inserting into the pore during a nucleic sequence-by- synthesis process. The tagged nucleoside-5 '-oligophosphates and nanopores disclosed herein can be used together to provide nanopore-based nucleic acid sequencing-by-synthesis systems and processes having reduced background tag levels and improved throughput. La présente divulgation concerne des nucléosides-5'-oligophosphates marqués ayant une structure de marqueur polymère à charge positive et leurs composants. Ces nucléoside- 5'-oligophosphates sont utiles, par exemple, dans les applications de séquençage par synthèse basées sur les nanopores. Sont également divulguées ici des constructions de nanopores conçues pour avoir des parties supplémentaires à charge négative dans le canal du nanopore. Ces nanopores peuvent être utiles, par exemple, pour fournir une force répulsive contre les acides nucléiques matrice et/ou amorce s'insérant dans le pore pendant un processus de synthèse par séquence nucléique. Les nucléoside-5'-oligophosphates marqués et les nanopores divulgués dans la présente peuvent être utilisés ensemble pour fournir des systèmes et des procédés de séquençage par synthèse d'acides nucléiques basés sur les nanopores, présentant des niveaux de marquage de fond réduits et un débit amélioré.