PROCESSING BIOPHYSICAL SCREENING DATA AND IDENTIFYING AND CHARACTERIZING PROTEIN SITES FOR DRUG DISCOVERY

• Main Authors: HERMANN, Johannes, DE OLIVEIRA, Saulo, VARMA, Chris
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 03.02.2022
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Techniques for characterizing protein candidate sites are provided. Experimental data comprising spectral data from an experimental data source is received. Based on the experimental data, a data set comprising a set of protein candidate sites within one or more proteins is created. For each protein candidate site of the set of protein candidate sites, a feature set characterizing the respective protein candidate site is generated. A characterization of the amenability for drug-discovery for one or more of the protein candidate sites is generated by applying a classifier to the respective feature set for the protein candidate site. L'invention concerne des techniques pour caractériser des sites protéiques candidats. Des données expérimentales comprenant des données spectrales provenant d'une source de données expérimentales sont reçues. Sur la base des données expérimentales, un ensemble de données comprenant un ensemble de sites protéiques candidats dans une ou plusieurs protéines est créé. Pour chaque site protéique candidat de l'ensemble de sites protéiques candidats, un ensemble de caractéristiques caractérisant le site protéique candidat respectif est généré. Une caractérisation de l'aptitude à la découverte de médicament pour un ou plusieurs des sites protéiques candidats est générée par application d'un classificateur à l'ensemble de caractéristiques respectif pour le site protéique candidat.