DUAL BARCODE INDEXES FOR MULTIPLEX SEQUENCING OF ASSAY SAMPLES SCREENED WITH MULTIPLEX IN-SOLUTION PROTEIN ARRAY

• Main Authors: LABAER, Joshua, PARK, Jin, RAUF, Femina
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 27.01.2022
• Subjects: CHEMISTRY; COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES; METALLURGY

Provided herein are compositions comprising coordinated sets of unique DNA barcodes and methods for using the same for multiplex detection and measurement of multiple target molecules in multiple samples using a single next-generation sequencing reaction. In particular, methods are provided in which unique DNA barcodes linked to affinity reagents are contacted to a sample to bind antigens if present in said sample, and then a PCR-based amplification reaction adds barcoded index sequences that contain universal sequencing adaptors as well as unique barcode sequences and amplifies affinity reagent-bound targets for DNA sequencing. L'invention concerne des compositions comprenant des ensembles coordonnés de codes-barres d'ADN uniques et des procédés d'utilisation de ceux-ci pour la détection multiplexe et la mesure de multiples molécules cibles dans de multiples échantillons à l'aide d'une seule réaction de séquençage nouvelle génération. L'invention concerne en particulier des procédés dans lesquels des codes-barres d'ADN uniques liés à des réactifs d'affinité sont mis en contact avec un échantillon pour lier des antigènes si présents dans ledit échantillon, puis une réaction d'amplification basée sur la PCR ajoute des séquences d'index de code-barres qui contiennent des adaptateurs de séquençage universels ainsi que des séquences de code-barres uniques et amplifie des cibles liées aux réactifs d'affinité pour le séquençage d'ADN.