METHOD FOR DETERMINING SINGLE BASE MUTATION OF ERM (41) GENE OF ACID-FAST BACILLUS BELONGING TO MYCOBACTEROIDES ABSCESSUS COMPLEX, AND PRIMER SET AND PROBE USED IN SAID METHOD

• Main Authors: MIYAMOTO Shigehiko, YOSHIDA Mitsunori, SANO Sotaro, HOSHINO Yoshihiko
• Format: Patent
• Language: English; French; Japanese
• Published: 07.10.2021
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

One or more embodiments of the present invention provides a novel means for determining a single base mutation of erm (41) gene of acid-fast bacillus belonging to Mycobacteroides abscessus complex.　One or more embodiments relate to a method for determining a base corresponding to position 28 of erm (41) gene of acid-fast bacillus belonging to Mycobacteroides abscessus complex, the method including detection of an index base sequence in the genome DNA of acid-fast bacillus which is a subject for determination, where the index base sequence is present in a region of the genome DNA other than the erm (41) gene when the base of the erm (41) gene is cytosine, and is not present when the base is thymine, thereby establishing that the presence of the index base sequence indicates that the base is cytosine, and the absence of the index base sequence indicates that the base is thymine. Un ou plusieurs modes de réalisation de la présente invention fournissent un nouveau moyen de déterminer une mutation d'une seule base du gène erm (41) d'un bacille acido-résistant appartenant au complexe Mycobacteroides abscessus.　Un ou plusieurs modes de réalisation concernent un procédé pour déterminer une base correspondant à la position 28 du gène erm (41) d'un bacille acido-résistant appartenant au complexe Mycobacteroides abscessus, le procédé comprenant la détection d'une séquence de base d'index dans l'ADN du génome du bacille acido-résistant qui est un sujet de détermination, où la séquence de base d'index est présente dans une région de l'ADN du génome autre que le gène erm (41) lorsque la base du gène erm (41) est la cytosine, et n'est pas présente lorsque la base est la thymine, établissant ainsi que la présence de la séquence de base d'index indique que la base est la cytosine, et que l'absence de la séquence de base d'index indique que la base est la thymine. 本発明の一以上の実施形態は、マイコバクテロイデス・アブセッサス・コンプレックスに属する抗酸菌において、ｅｒｍ（４１）遺伝子の一塩基変異を判別するための新たな手段を提供する。　本発明の一以上の実施形態は、マイコバクテロイデス・アブセッサス・コンプレックスに属する抗酸菌において、ｅｒｍ（４１）遺伝子の第２８位に相当する塩基を判定する方法であって、前記ｅｒｍ（４１）遺伝子の前記塩基がシトシンの場合にゲノムＤＮＡの前記ｅｒｍ（４１）遺伝子以外の領域に存在し、チミンの場合に存在しない指標塩基配列を、判定対象の抗酸菌のゲノムＤＮＡにおいて検出することを含み、前記指標塩基配列の存在が、前記塩基がシトシンであることを示し、前記指標塩基配列の不存在が、前記塩基がチミンであることを示す、方法に関する。