IN VITRO EVALUATION METHOD FOR RISK OF CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE ASSOCIATED WITH SMOKING OR INHALATION
The present invention relates to an in vitro evaluation method for the risk of chronic obstructive pulmonary disease associated with smoking or inhalation This method comprises: (1) calculating the probability PSMK on the basis of data relating to the expression of 11 or more genes including at leas...
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Format | Patent |
Language | English French Japanese |
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16.07.2020
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Summary: | The present invention relates to an in vitro evaluation method for the risk of chronic obstructive pulmonary disease associated with smoking or inhalation This method comprises: (1) calculating the probability PSMK on the basis of data relating to the expression of 11 or more genes including at least 11 specific genes from among the following 15 genes from airway epithelial cells exposed to a sample solution containing an aerosol of a tobacco product or particulate matter in the aerosol using an intercept and a coefficient preliminarily calculated by logistic regression analysis using public data, the 15 genes being TXNIP, EFNA1, CYP1 B1, ADM, AREG, DUSP6, SLC7A11, IGFBP3, WNT5A, CXCR4, PHLDA1, HILPDA, ZBED2, EGLN3, and FBXO32; (2) calculating the probability PCOPD on the basis of data relating to the expression of 4 or more genes including at least 4 specific genes from among the following 15 genes from the airway epithelial cells exposed to a sample solution containing an aerosol of a tobacco product or particulate matter in the aerosol using the coefficient preliminarily calculated by logistic regression analysis using the public data; and (3) calculating the risk of chronic obstructive pulmonary disease associated with smoking or inhalation of the aerosol of the tobacco product or an aerosol from the probability PSMK and the probability PCOPD.
La présente invention concerne un procédé d'évaluation in vitro pour le risque de maladie pulmonaire obstructive chronique associée à un fumage ou une inhalation. Ce procédé comprend les étapes suivantes : (1) calculer la probabilité PSMK sur la base de données relatives à l'expression d'au moins 11 gènes comprenant au moins 11 gènes spécifiques parmi les 15 gènes suivants provenant de cellules épithéliales de voies respiratoires exposées à une solution d'échantillon contenant un aérosol d'un produit de tabac ou de matière particulaire dans l'aérosol à l'aide d'une interception et d'un coefficient calculé au préalable par analyse de régression logistique à l'aide de données publiques, les 15 gènes étant TXNIP, EFNA1, CYP1 B1, ADM, AREG, DUSP6, SLC7A11, IGFBP3, WNT5A, CXCR4, PHLDA1, HILPDA, ZBED2, EGLN3, et FBXO32 ; (2) calculer la probabilité PCOPD sur la base de données relatives à l'expression d'au moins 4 gènes comprenant au moins 4 gènes spécifiques parmi les 15 gènes suivants provenant de cellules épithéliales de voies respiratoires exposées à une solution d'échantillon contenant un aérosol d'un produit de tabac ou de matière particulaire dans l'aérosol à l'aide du coefficient calculé au préalable par analyse de régression logistique à l'aide de données publiques ; et (3) calculer le risque de maladie pulmonaire obstructive chronique associée au tabagisme ou à l'inhalation de l'aérosol du produit de tabac ou d'un aérosol à partir de la probabilité PSMK et de la probabilité PCOPD.
本発明は、喫煙または吸引による慢性閉塞性肺疾患のリスクのインビトロ評価方法に関する。 本発明の方法は、 (1)たばこ製品のエアロゾルあるいはエアロゾル中の粒子状物質を含む試料溶液に曝露した気道上皮細胞における以下の15個の遺伝子:TXNIP,EFNA1,CYP1 B1,ADM,AREG,DUSP6,SLC7A11,IGFBP3,WNT5A,CXCR4,PHLDA1,HILPDA,ZBED2,EGLN3,FBXO32のうちの少なくとも特定の11個の遺伝子を含む11以上の遺伝子の発現に関するデータに基づき、あらかじめ公共データを用いたロジスティック回帰分析により算出された切片および係数を用いて、確率PSMKを算出し; (2)たばこ製品のエアロゾルあるいはエアロゾル中の粒子状物質を含む試料溶液に曝露した気道上皮細胞における以下の15個の遺伝子のうちの少なくとも特定の4個の遺伝子を含む4以上の遺伝子の発現に関するに基づき、あらかじめ公共データを用いたロジスティック回帰分析により算出された係数を用いて、確率PCOPDを算出し; (3)確率PSMKおよび確率PCOPDから、前記たばこ製品のエアロゾルまたはエアロゾルの喫煙または吸引による慢性閉塞性肺疾患のリスクをとして算出する、 ことを含む。 |
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Bibliography: | Application Number: WO2019JP49086 |