METHOD FOR IDENTIFYING AN UNKNOWN BIOLOGICAL SAMPLE FROM MULTIPLE ATTRIBUTES

• Main Authors: NGUYEN-KHUONG, Terry, RUDD, Pauline Mary, WALSH, Ian, WONGTRAKULKISH, Katherine Louisa
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 28.05.2020
• Subjects: INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; PHYSICS; TESTING

A method for identifying an unknown biological sample (e.g. a glycan, an antibody, a metabolite) is disclosed. The method comprises: receiving more than two sample measurements for the unknown biological sample, calculating a sample point in a two-dimensional plot from the more than two sample measurements for the unknown biological sample and identifying the unknown biological sample by comparing the sample point against the plurality of reference points in the two-dimensional plot. The two-dimensional plot includes a plurality of stored reference points corresponding to respective known biological compounds. Each reference point is calculated from a plurality of reference measurements for more than two attributes of the corresponding known biological compound (e.g. by performing principal component analysis on the plurality of reference measurements), with each attribute being different from another attribute. Each reference measurement may be obtained experimentally (e.g. by liquid chromatography, mass spectrometry, tandem mass spectrometry, ion mobility spectrometry) or by a machine learning algorithm. L'invention concerne un procédé d'identification d'un échantillon biologique inconnu (par exemple un glycane, un anticorps, un métabolite). Le procédé consiste à : recevoir plus de deux mesures d'échantillon pour l'échantillon biologique inconnu, calculer un point d'échantillon dans un tracé bidimensionnel réalisé à partir desdites mesures d'échantillon pour l'échantillon biologique inconnu et identifier l'échantillon biologique inconnu en comparant le point d'échantillon à la pluralité de points de référence dans le tracé bidimensionnel. Le tracé bidimensionnel comprend une pluralité de points de référence stockés correspondant à des composés biologiques connus respectifs. Chaque point de référence est calculé à partir d'une pluralité de mesures de référence pour plus de deux attributs du composé biologique connu correspondant (par exemple en effectuant une analyse du composant principal sur la pluralité de mesures de référence), chaque attribut étant différent d'un autre attribut. Chaque mesure de référence peut être obtenue expérimentalement (par exemple par chromatographie liquide, spectrométrie de masse, spectrométrie de masse en tandem, spectrométrie de mobilité ionique) ou par un algorithme d'apprentissage automatique.