SYSTEMS AND METHODS FOR USING IMAGE PROCESSING TO GENERATE INFERENCES OF BIOMARKER FOR IMMUNOTHERAPY

Methods and systems are disclosed for image process biological samples to infer biomarker values. An image of a biological sample can be accessed. The image can be segmented into a set of patches. Edge detection performed on each patch can be used to identify one or more biological features represen...

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Main Authors KULIG, Kimary, CHANG, Huang-Wei, CIMERMANCIC, Peter, SOLINAS, Graziella, BATENCHUK, Cory
Format Patent
LanguageEnglish
French
Published 23.04.2020
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Summary:Methods and systems are disclosed for image process biological samples to infer biomarker values. An image of a biological sample can be accessed. The image can be segmented into a set of patches. Edge detection performed on each patch can be used to identify one or more biological features represented by the patch. An indication of the one or more features of each patch may be used to generate one or more image level metrics. A value of a biomarker may be inferred using the one or more image level metrics. The value of the biomarker can then be output. L'invention concerne des procédés et des systèmes destinés à appliquer un traitement d'images à des échantillons biologiques pour en déduire des valeurs de biomarqueurs. Une image d'un échantillon biologique peut faire l'objet d'un accès. L'image peut être segmentée en un ensemble de pièces. Une détection de contours effectuée sur chaque pièce peut être utilisée pour identifier une ou plusieurs caractéristiques biologiques représentées par la pièce. Une indication de la ou des caractéristiques de chaque pièce peut être utilisée pour générer une ou plusieurs métriques au niveau de l'image. Une valeur d'un biomarqueur peut être déduite en utilisant la ou les métriques au niveau de l'image. La valeur du biomarqueur peut alors être délivrée.
Bibliography:Application Number: WO2019US56140