QUANTITATIVE DETECTION AND DISCRIMINATION OF TARGET GENETIC MATERIAL BY HIGH-THROUGHPUT DNA ANALYSIS

• Main Authors: PAYTON, Adam, CURRIE, Richard, NEVES, Leandro, DALIBERTI, Mary
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 13.02.2020
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMBINATORIAL CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES; MEASURING; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; TESTING; VINEGAR; WINE

Polymerase chain reaction (PCR) based assays are provided for detection and quantification of one or more target genetic loci. In preferred embodiments, multiplex assays are provided for detection and quantification of a plurality of target genetic loci. The assays comprise amplifying via PCR one or more target genetic loci and one or more control genetic loci in a genetic material in a sample obtained from a subject. The amplified PCR amplicons are quantified to determine the amount of the one or more target genetic loci relative to the amount of one or more control genetic loci. The methods of the invention can be used to identify and quantify microorganisms, nucleic acid based vaccines, or other nucleic acids in a sample using a sample specific normalization control. Kits comprising primer pairs, probes and other reagents for performing the assays of the invention are also provided. La présente invention concerne des essais à base de réaction en chaîne de la polymérase (PCR) pour la détection et la quantification d'un ou plusieurs loci génétiques cibles. Dans des modes de réalisation préférés, de multiples essais sont prévus pour la détection et la quantification d'une pluralité de loci génétiques cibles. Les essais comprennent l'amplification par PCR d'un ou plusieurs loci génétiques cibles et d'un ou plusieurs loci génétiques témoins dans un matériau génétique d'un échantillon obtenu à partir d'un sujet. Les amplicons PCR amplifiés sont quantifiés pour déterminer la quantité d'un ou plusieurs loci génétiques cibles par rapport à la quantité d'un ou plusieurs loci génétiques témoins. Les procédés de l'invention peuvent être utilisés pour identifier et quantifier des micro-organismes, des vaccins à base d'acide nucléique, ou d'autres acides nucléiques dans un échantillon à l'aide d'un témoin de normalisation spécifique à l'échantillon. L'invention concerne également des kits comprenant des paires d'amorces, des sondes et d'autres réactifs pour effectuer les essais.