METHODS OF CHEMICAL COMPUTATION

• Main Authors: ARCADIA, Christopher, OAKLEY, Kady, RUBENSTEIN, Brenda, GEISER, Joseph, SELLO, Jason, ROSE, Christopher, WEBER, Peter, DOMBROSKI, Amanda, CHEN, Shui, ROSENSTEIN, Jacob, KIM, Eunsuk, REDA, Sherief, TANN, Hokchhay, KENNEDY, Eamonn
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 12.03.2020
• Subjects: CALCULATING; COMPUTER SYSTEMS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS; COMPUTING; COUNTING; PHYSICS

The invention provides methods for computing with chemicals by encoding digital data into a plurality of chemicals to obtain a dataset; translating the dataset into a chemical form; reading the data set; querying the dataset by performing an operation to obtain a perceptron; and analyzing the perceptron for identifying chemical structure and/or concentration of at least one of the chemicals, thereby developing a chemical computational language. The invention demonstrates a workflow for representing abstract data in synthetic metabolomes. Also presented are several demonstrations of kilobyte-scale image data sets stored in synthetic metabolomes, recovered at >99% accuracy. L'invention concerne des procédés de calcul avec des produits chimiques par codage de données numériques en une pluralité de produits chimiques pour obtenir un ensemble de données; la traduction de l'ensemble de données en une forme chimique; la lecture de l'ensemble de données; l'interrogation de l'ensemble de données en effectuant une opération pour obtenir un perceptron; et l'analyse du perceptron pour identifier une structure chimique et/ou une concentration d'au moins un des produits chimiques, permettant ainsi le développement d'un langage chimio-informatique. L'invention présente un flux de travail pour représenter des données abstraites dans des métabolomes synthétiques. L'invention concerne également plusieurs démonstrations d'ensembles de données d'image d'échelle de kilooctets stockées dans des métabolomes synthétiques, récupérées à >99 % de précision.