PRIMER SET, PROBE, KIT, AND METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIUM KANSASII

• Main Authors: MIYAMOTO Shigehiko, TOMONO Jun, HATA Hiroyuki, KAWAI Akiko, SANO Sotaro, JIKIHARA Takaaki
• Format: Patent
• Language: English; French; Japanese
• Published: 26.07.2018
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

The present invention provides a novel means for species-specifically detecting M. kansasii. This primer set includes: a first primer that includes a polynucleotide including at the 3' end a base sequence A' identical or homologous to a base sequence A that is a partial base sequence of the 5' end of a target region including all or part of a first base sequence shown by SEQ ID NOS: 1, 9, 11, 13, 15, 2, 10, 12, 14, or 16 in the genomic DNA of Mycobacterium kansasii or a second base sequence complementary to the first base sequence; and a second primer that includes a polynucleotide including at the 3' end a base sequence B' identical or homologous to a complementary base sequence of a base sequence B that is a partial base sequence at the 3' end of the target region. La présente invention concerne un nouveau moyen pour détecter spécifiquement l'espèce M. kansasii. L'ensemble d'amorces selon l'invention comprend : une première amorce qui comprend un polynucléotide comprenant en l'extrémité 3' une séquence de bases A' identique ou homologue à une séquence de bases A qui est une séquence de bases partielle de l'extrémité 5' d'une région cible comprenant tout ou une partie d'une première séquence de bases représentée par les séquences SEQ ID NO : 1, 9, 11, 13, 15, 2, 10, 12, 14 ou 16 dans l'ADN génomique de Mycobacterium kansasii ou d'une deuxième séquence de bases complémentaire à la première séquence de bases ; et une deuxième amorce qui comprend un polynucléotide comprenant en l'extrémité 3' une séquence de bases B' identique ou homologue à une séquence de bases complémentaire à une séquence de bases B qui est une séquence de bases partielle en l'extrémité 3' de la région cible. 本発明は、Ｍ．カンサシイを種特異的に検出するための新たな手段を提供する。　本発明のプライマーセットは、マイコバクテリウム・カンサシイのゲノムＤＮＡにおける、配列番号１、９、１１、１３、１５、２、１０、１２、１４又は１６に示す第１塩基配列或いは第１塩基配列に相補的な第２塩基配列の全体又は一部分を含む標的領域の、５'末端の部分塩基配列である塩基配列Ａと同一又は相同な塩基配列Ａ'を３'末端に含むポリヌクレオチドを含む、第１プライマーと、前記標的領域の３'末端の部分塩基配列である塩基配列Ｂの相補塩基配列と同一又は相同な塩基配列Ｂ'を３'末端に含むポリヌクレオチドを含む、第２プライマーとを含む。