METHOD FOR EXAMINING MICROORGANISM, KIT FOR EXAMINING MICROORGANISM, MICROARRAY FOR EXAMINING MICROORGANISM, CARRIER FOR DETECTING MOLD, METHOD FOR DETECTING MOLD AND KIT FOR DETECTING MOLD

• Main Author: ISSHIKI, Atsunori
• Format: Patent
• Language: English; French; Japanese
• Published: 22.12.2016
• Subjects: APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; TESTING; VINEGAR; WINE

The present invention enables appropriate detection of microorganisms belonging to the genera Plasmodiophora, Pythium and Phytophthora. A method for examining microorganisms that comprises collecting a sample from a plant tissue, soil, water or another environment, extracting DNA from microorganisms contained in the sample, conducting PCR with the use of the extracted DNA, and determining the presence or absence of microorganisms in the sample on the basis of the obtained amplification product, wherein the aforesaid PCR is conducted with the use of a primer set targeting, as the PCR amplification target, β-tubulin gene in DNA of microorganisms belonging to the genera Plasmodiophora, Pythium and Phytophthora, said primer set consisting of a forward primer comprising at least any one of base sequences represented by SEQ ID NOS: 1-3 and a reverse primer comprising at least any one of base sequences represented by SEQ ID NOS: 4 and 5, and the extracted DNA, and then the presence or absence of the microorganisms in the sample is determined on the basis of the obtained amplification product. La présente invention permet une bonne détection de microorganismes appartenant aux genres Plasmodiophora, Pythium et Phytophthora. L'invention concerne un procédé d'étude de microorganismes qui comprend le prélèvement d'un échantillon provenant d'un tissu végétal, du sol, de l'eau ou d'un autre environnement, l'extraction de l'ADN de microorganismes contenus dans l'échantillon, la mise en œuvre d'une PCR à l'aide de l'ADN extrait, et la détermination de la présence ou de l'absence de microorganismes dans l'échantillon sur la base du produit d'amplification obtenu, dans lequel ladite PCR est mise en œuvre en utilisant un ensemble d'amorces ciblant, en tant que cible d'amplification de la PCR, le gène de la β-tubuline dans l'ADN de microorganismes appartenant aux genres Plasmodiophora, Pythium et Phytophthora, ledit ensemble d'amorces comprenant une amorce sens comportant au moins l'une quelconque des séquences de bases représentées par SEQ ID NO : 1 à 3 et une amorce antisens comprenant au moins l'une quelconque des séquences de bases représentées par SEQ ID NO : 4 et 5, et l'ADN extrait. Par la suite, la présence ou l'absence des microorganismes dans l'échantillon est déterminée sur la base du produit d'amplification obtenu. プラズモディオフォラ属菌、ピシウム属菌、及びフィトフトラ属菌を好適に検出することを可能とする。植物組織または土壌、水、もしくはその他の環境中から試料を採取し、試料に含まれる微生物群からＤＮＡを抽出し、抽出されたＤＮＡを用いてＰＣＲを行い、得られた増幅産物に基づき試料における微生物の有無を判定する微生物の検査方法であって、プラズモディオフォラ属菌、ピシウム属菌、及びフィトフトラ属菌のＤＮＡにおけるβ-チューブリン遺伝子をＰＣＲによる増幅の標的とする配列番号１～３に示す塩基配列の少なくともいずれかからなるフォワードプライマーと、配列番号４、５に示す塩基配列の少なくともいずれかからなるリバースプライマーとからなるプライマーセットと、抽出されたＤＮＡを用いてＰＣＲを行い、得られた増幅産物に基づき、試料におけるこれらの菌の有無を判定する。