METHODS AND SYSTEMS FOR VOLUME VARIATION MODELING IN DIGITAL PCR

• Main Authors: MAJUMDAR, Nivedita Sumi, BANERJEE, Swapnonil
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 27.10.2016
• Subjects: INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

A method for performing digital polymerase chain reaction (dPCR) is provided. The method comprises partitioning a biological sample volume including a plurality of target nucleic acids into a plurality of partitions. At least one partition includes at least one target nucleic acid. The method further includes determining a model for volume variation of the plurality of partitions and determining a fraction of partitions including at least one target nucleic acid. The method includes generating a concentration of target nucleic acids in the biological sample based on the model for volume variation and the fraction of partitions including at least one target nucleic acid. La présente invention concerne un procédé destiné à la mise en œuvre d'une amplification en chaîne par polymérase numérique (dPCR). Le procédé consiste à partitionner un volume d'échantillon biologique comprenant une pluralité d'acides nucléiques cibles dans une pluralité de partitions. Au moins une partition comprend au moins un acide nucléique cible. Le procédé consiste en outre à déterminer un modèle destiné à une variation de volume de la pluralité de partitions et à déterminer une fraction de partitions comprenant au moins un acide nucléique cible. Le procédé comprend la génération d'une concentration d'acides nucléiques cibles dans l'échantillon biologique en fonction du modèle destiné à la variation de volume et de la fraction de partitions comprenant au moins un acide nucléique cible.