METHODS AND COMPOSITIONS FOR DIAGNOSIS OF GLIOBLASTOMA OR A SUBTYPE THEREOF

• Main Authors: O'ROURKE, DONALD, M, MACYSZYN, LUKE, DAVULURI, RAMANA, V, BI, YINGTAO, PAL, SHARMISTHA, SHOWE, LOUISE, C
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 09.10.2014
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

An isoform-level gene panel is disclosed that can accurately classify a glioblastoma subtype from a tumor sample. Such an isoform level gene panel comprises the 121 to 214 target isoforms identified in Table 1. Also disclosed are reagents for quantitively detecting the expression or activity of the target isoforms of Table 1 in a patient sample. For example, such ligands can be PCR primer and probes sets. This isoform-level gene panel and reagents for detection of the isoforms are useful in an isoform-level assay for diagnosis of the molecular subtype of a glioblastoma in a patient. The assay employs algorithms and a novel computer program that performs the functions of Figure 8. In one aspect, the assay is a high-throughput format. L'invention concerne un panel de gènes du type isoformes capable de répertorier avec précision un sous-type de glioblastome dans un échantillon de tumeur. Ce panel comprend les isoformes cibles 121 à 214 répertoriées dans le tableau 1. L'invention concerne également des réactifs permettant de détecter quantitativement l'expression ou l'activité des isoformes cibles du tableau 1 dans un échantillon prélevé chez un patient. Par exemple, ces ligands peuvent être des séries de sondes et d'amorces pour PCR. Ce panel et ces réactifs de détection des isoformes sont utilisés dans un dosage d'isoformes pour le diagnostic du sous-type moléculaire d'un glioblastome chez un patient. Le dosage utilise des algorithmes et un nouveau programme informatique qui exécute les fonctions de la figure 8. Dans un aspect, le dosage est un format à haut débit.