METHOD FOR PREDICTING THE OFF-TARGET BIDING OF A PEPTIDE WHICH BINDS TO A TARGET PEPTIDE PRESENTED BY A MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX

• Main Authors: CAMERON, BRIAN JOHN, VUIDEPOT, ANNELISE BRIGITTE, JAKOBSEN, BENT KARSTEN
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 26.06.2014
• Subjects: CHEMISTRY; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; METALLURGY; ORGANIC CHEMISTRY; PEPTIDES; PHYSICS; TESTING

The invention provides a method for predicting whether a binding peptide, which binds to a target peptide presented by a Major Histocompatibility Complex (MHC) and is for administration to a subject, has the potential to cross react with another peptide in the subject in vivo. The method comprises the steps of identifying at least one binding motif in the target peptide to which the binding peptide binds; and searching for peptides that are present in the subject that comprise the at least one binding motif and that are not the target peptide. The presence of one or more such peptides indicates that the binding peptide has the potential to cross react in vivo. Cette invention concerne une méthode permettant de prédire si un peptide de liaison, qui se lie à un peptide cible présenté par un complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) et est destiné à être administré à un sujet, a un pouvoir de réaction croisée avec un autre peptide chez ledit sujet in vivo. La méthode comprend les étapes consistant à identifier au moins un motif de liaison dans le peptide cible auquel le peptide de liaison se lie ; et à rechercher les peptides présents chez le sujet qui contiennent ce motif de liaison et ne sont pas le peptide cible. La présence d'un ou de plusieurs de ces peptides indique que le peptide de liaison a un pouvoir de réaction croisée in vivo.