METHODS AND REAGENTS FOR EVALUATING AUTOIMMUNE DISEASE AND DETERMINING ANTIBODY REPERTOIRE

• Main Authors: EASTMAN, ERIC, M, BIGWOOD, DOUGLAS, W
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 06.09.2013
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; TESTING; VINEGAR; WINE

The invention provides methods and kits for determining an antibody or T-cell receptor repertoire in a sample containing B-cells and/or T-cells, and provides a method for evaluating a patient for the presence of an autoimmune disorder. In one aspect, the invention provides methods and kits for determining an antibody or T-cell receptor repertoire in a sample containing B-cells and/or T-cells. The method comprises amplifying target polynucleotide sequences that encode an antigen binding region of an antibody gene family or T-cell receptor gene family using a set of nondegenerate primers, and determining the amplified sequences. In various embodiments, the sequences are clonally amplified, and a plurality of sequences generated. The set of non-degenerate primers comprises at least one primer specific for amplifying each member of a family of related sequences. L'invention concerne des procédés et des nécessaires qui permettent de déterminer un répertoire d'anticorps ou de récepteurs de lymphocytes T dans un échantillon contenant des lymphocytes B et/ou des lymphocytes T, et un procédé qui permet d'évaluer si un patient présente un trouble auto-immun. Selon un aspect, l'invention concerne des procédés et des nécessaires pour déterminer un répertoire d'anticorps et de récepteurs de lymphocytes T dans un échantillon contenant des lymphocytes B et/ou des lymphocytes T. Le procédé comporte l'amplification de séquences polynucléotidiques cibles qui codent pour une région de liaison à un antigène d'une famille de gènes d'anticorps ou d'une famille de gènes de récepteur de lymphocytes T à l'aide d'un ensemble d'amorces non dégénérées, et la détermination des séquences amplifiées. Dans divers modes de réalisation, les séquences amplifiées de façon clonale et une pluralité de séquences sont générées. L'ensemble d'amorces non dégénérées comprend au moins une amorce spécifique de l'amplification de chaque membre d'une famille de séquences associées.