REAL-TIME VIRAL DETECTION METHOD AND KIT FOR INFECTIOUS HYPODERMALAND HAEMATOPOIETIC NECROSIS VIRUS

• Main Authors: BHASSU, SUBHA A/P, BINTI OTHMAN, ROFINA, YASMIN, KHOON, TOO, LAY, CHU, KUA, BENG
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 06.09.2013
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

A method for quantitatively detecting infectious hypodermal and haematopoietic necrosis virus (IHHNV) in a biological sample, comprising the steps of obtaining a primer pair having nucleotide sequences set forth in SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2, and a fluorescent probe having a nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3; amplifying a non-structural protein coding region of the virus in the biological sample by a real-time polymerase chain reaction (PCR) using the primer pair and the fluorescent probe; and determining the presence and quantity of the virus in the biological sample with reference to a positive control plasmid. La présente invention concerne un procédé permettant de détecter de manière quantitative le virus de la nécrose hypodermique et hématopoïétique infectieuse (VNHHI) dans un échantillon biologique. Le procédé comprend les étapes consistant à obtenir une paire d'amorces comportant des séquences nucléotidiques présentées dans SEQ ID NO° 1 et SEQ ID NO° 2, et une sonde fluorescente comportant une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO° 3, amplifier une région de codage de protéine non-structurelle du virus dans l'échantillon biologique par une réaction de polymérisation en chaîne en temps réel (PCR) à l'aide de la paire d'amorces et la sonde fluorescente et à déterminer la présence et la quantité du virus dans l'échantillon biologique en référence à un plasmide de contrôle positif.