SYSTEM AND METHOD FOR STANDARDIZED, OPTIMIZED AND PRE-CONFIGURED QUANTITATIVE DIGITAL PATHOLOGY

• Main Authors: HANSEN, JOHAN DORE, GRUNKIN, MICHAEL
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 25.07.2013
• Subjects: CALCULATING; COMPUTING; COUNTING; ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING; IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL; PHYSICS

The invention is useful in quantitative digital pathology and provides a standardized method for preparing biological samples, acquiring digital images, and analysing the images through the use of a system for standardized, optimized and pre-configured quantitative digital pathology on biological samples. The system comprises a library of application packages wherein each application package sample preparation protocols for preparation of a biological sample, and at least one digital slide showing a biological sample prepared according to the instructions, instructions for image acquisition using an optimized image analysis algorithm optimized and documented based on data being at least one biological sample prepared according to the instructions and imaged according to the instructions. The application package also comprises at least one corresponding reference standard of the biological sample, an application description comprising at least information of the preparation protocol and the instructions for image acquisition. Furthermore, the system comprises a webbased presentation of the application description of a plurality of application packages in the library, said webbased presentation comprising an access request capability. The method may be executed on any suitable platform, and is particularly relevant for executing as a cloud application. L'invention s'utilise en pathologie numérique quantitative et concerne un procédé normalisé pour préparer des échantillons biologiques, acquérir des images numériques et analyser lesdites images par utilisation d'un système pour pathologie numérique quantitative préconfigurée, optimisée et normalisée sur des échantillons biologiques. Le système comprend une bibliothèque de progiciels d'application, chaque progiciel d'application comprenant des protocoles de préparation d'échantillon de progiciel d'application pour préparer 'un échantillon biologique, ainsi qu'au moins un cliché numérique montrant un échantillon biologique préparé conformément aux instructions, des instructions permettant une acquisition d'image au moyen d'un algorithme d'analyse d'image optimisé et documenté sur la base de données représentant au moins un échantillon biologique préparé conformément aux instructions et imagé conformément aux instructions. Le progiciel d'application comprend également au moins une norme de référence correspondante de l'échantillon biologique, une description d'application comprenant au moins des informations du protocole de préparation et les instructions pour une acquisition d'image. En outre, le système comprend une présentation web de la description d'application d'une pluralité de progiciels d'application dans la bibliothèque, ladite présentation web comprenant une capacité de demande d'accès. Le procédé peut être exécuté sur n'importe quelle plate-forme appropriée et est particulièrement approprié pour une exécution sous forme d'application en nuage.