IDENTIFICATION METHOD OF SPECIES OF DIATOMS IN COAST OF KOREA, AND POLYNUCLEOTIDE PROBE, DNA CHIP AND KIT FOR IDENTIFICATION OF SPECIES OF DIATOMS ACCORDING TO SAME

• Main Authors: LEE, YOUN-HO, LEE, TEAK-KYUN, HWANG, JIN-IK, PARK, SO-YUN, LEE, GUN-SEOP, CHANG, MAN
• Format: Patent
• Language: English; French; Korean
• Published: 22.09.2011
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

The present invention relates to an identification method of species of diatoms inhabiting the coast of Korea, and a polynucleotide probe, a DNA chip and a kit for identification for species of diatoms for the method. The identification method comprises the following steps: carrying out polymerase chain reaction (PCR) of the DNA extracted from diatoms to obtain a PCR product; binding the PCR product to each probe comprising a base sequence identical or complementary to one or more DNA sequences of sequence numbers 3-51; and identifying the species of the diatoms according to whether the PCR product binds or not. The present invention can analyze the genotype of diatoms inhabiting the coast of Korea and can simply, rapidly and accurately identify the species thereof on the basis of single nucleotide polymorphism (SNPs) of various species of diatoms. La présente invention concerne un procédé d'identification d'espèces de diatomées poussant sur la côte de Corée, et une sonde polynucléotidique, une puce à ADN et un kit d'identification d'espèces de diatomées pour le procédé. Le procédé d'identification comprend les étapes suivantes : réalisation d'une amplification en chaîne par polymérase (ACP) de l'ADN extrait de diatomées afin d'obtenir un produit d'ACP ; liaison du produit d'ACP à chaque sonde comprenant une séquence de bases identique ou complémentaire à une ou plusieurs séquences d'ADN de numéros de séquence 3 à 51 ; et identification des espèces des diatomées en fonction de la liaison ou non du produit d'ACP. La présente invention permet l'analyse du génotype de diatomées poussant sur la côte de Corée et l'identification simple, rapide et précise de leurs espèces à partir d'un polymorphisme mononucléotidique (SNP) de diverses espèces de diatomées.