CATEGORIZATION AND FILTERING OF SCIENTIFIC DATA

• Main Authors: ALAG, SATNAM, KUPERSHMIDT, ILYA, LIU, QINGDI, SUNDARESH, SUMAN, SU, QIAOJUAN, JANE
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 11.09.2009
• Subjects: CALCULATING; COMPUTING; COUNTING; ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

The present invention relates to methods, systems and apparatus for capturing, integrating, organizing, navigating and querying large-scale data from high-throughput biological and chemical assay platforms. It provides a highly efficient meta-analysis infrastructure for performing research queries across a large number of studies and experiments from different biological and chemical assays, data types and organisms, as well as systems to build and add to such an infrastructure. According to various embodiments, methods, systems and interfaces for associating experimental data, features and groups of data related by structure and/or function with chemical, medical and/or biological terms in an ontology or taxonomy are provided. According to various embodiments, methods, systems and interfaces for filtering data by data source information are provided, allowing dynamic navigation through large amounts of data to find the most relevant results for a particular query. La présente invention concerne des procédés, des systèmes et un appareil pour saisir, intégrer, organiser, naviguer et interroger des données à grande échelle à partir de plates-formes d'essais biologiques et chimiques à haut débit. Elle comprend une infrastructure de méta-analyse très efficace pour réaliser des interrogations de recherche sur un grand nombre d'études et d'expériences à partir de différents essais biologiques et chimiques, de types de données et d'organismes, ainsi que des systèmes pour construire et s'ajouter à une telle infrastructure. Selon divers modes de réalisation, l'invention concerne des procédés, des systèmes et des interfaces pour associer des données expérimentales, des caractéristiques et des groupes de données liées par structure et/ou par fonction à des termes chimiques, médicaux et/ou biologiques dans une ontologie ou une taxonomie. Selon divers modes de réalisation, l'invention concerne des procédés, des systèmes et des interfaces pour filtrer des données par des informations de sources de données, permettant une navigation dynamique parmi de grandes quantités de données de manière à trouver les résultats les plus adéquats pour une interrogation particulière.