A CRYSTALLOGRAPHIC MODEL OF THE BINDING SITE AND A MODULATOR REGULATING THE CATALYTIC ACTIVITY OF PHOSPHOFRUCTOKINASE (PFK), A METHOD OF DESIGNING, SELECTING AND PRODUCING THE PFK MODULATOR, A COMPUTER-BASED METHOD FOR THE ANALYSIS OF THE INTERACTION

• Main Authors: RYPNIEWSKI, WOJCIECH, MECHIN, INGRID, BANASZAK, KATARZYNA
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 24.06.2010
• Subjects: CALCULATING; COMPUTING; COUNTING; ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

The subject matters of the invention are: a crystallographic model of the binding site and a modulator regulating the catalytic activity of phosphofructokinase (PFK), a method of designing, selecting and producing a PFK modulator, a computer-based method for the analysis of the interaction between the modulator and PFK and for the analysis of molecular structures, a computer-based method of drug design, a method of assessing the ability of the potential modulator to interact in the binding site on the PFK surface, a method of providing data for generating structures and/or performing design for drugs that bind PFK, PFK homologues or analogues, complexes of PFK with a potential modulator, or complexes of PFK homologues or analogues with potential modulators, a computer system. La présente invention concerne un modèle cristallographique du site de liaison et un modulateur de régulation de l'activité catalytique de la phosphofructokinase (PFK), un procédé de conception, de sélection et de production d'un modulateur de PFK, un procédé informatisé destiné à l'analyse des interactions entre le modulateur et la PFK ainsi qu'à l'analyse de structures moléculaires, un procédé informatisé de conception de médicament, un procédé d'évaluation de la capacité du modulateur potentiel d'interagir dans le site de liaison sur la surface de la PFK, un procédé de fourniture de données permettant de générer des structures et/ou de concevoir des médicaments qui se lient à la PFK, à des homologues ou des analogues de la PFK, à des complexes de la PFK avec un modulateur potentiel, ou à des complexes d'homologues ou d'analogues de la PFK avec des modulateurs potentiels. L'invention concerne également un système informatique.