CLASSIFICATION OF PROTEIN SEQUENCES AND USES OF CLASSIFIED PROTEINS

• Main Authors: HORN, DAVID, SOLAN, ZACH, SANDBANK, BEN, RUPPIN, EYTAN, MEROZ, YASMINE, WEINGART, URI, KUNIK, VERED
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 22.11.2007
• Subjects: INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

A searchable protein database is disclosed. The protein database comprises a plurality of entries, each entry having a sufficiently short predicting sequence and a protein classifier corresponding to the predicting sequence. An unclassified protein sequence can be classifiable by the database via searching therein for a motif of amino acids matching a predicting sequence of the database, thereby attributing to the unclassified protein a protein classifier. L'invention concerne une base de données de protéines interrogeable. Cette base de données de protéines comprend une pluralité d'entrées, chaque entrée possédant une séquence de prédiction suffisamment courte et un classifieur de protéine correspondant à la séquence de prédiction. Une séquence protéique non classifiée peut être classifiée au moyen de la base de données par recherche dans celle-ci d'un motif d'acides aminés correspondant à une séquence de prédiction de la base de données, ce qui permet d'attribuer un classifieur de protéine à la protéine non classifiée.